基于Pathway蛋白质组学的质谱优选肽段自动挑选方法

摘要

本发明涉及一种基于Pathway蛋白质组学的质谱优选肽段自动挑选方法，包括以下步骤：A.使用目标代谢通路上所有涉及到的蛋白质名称对待研究生物的全蛋白序列进行目标蛋白群的提取；B.对所提取的目标蛋白群进行理论酶切，产生所有目标蛋白的理论酶切肽段；C.计算所有的理论酶切肽段的理论分子量(Mass)、理论保留时间(NET)、等电点(pI)；D.筛选符合条件的理论肽段，得到质谱的优选肽段集合，作为在实际实验的每个segment中设定优选肽段的依据。本发明提供的方法便于计算机实现，可以取代传统的人工手动挑选方式，大大提高蛋白质组实验的效率，并提高发生含量变化的蛋白的检出率，使蛋白质组的研究更加便捷与准确。

主权项

一种基于Pathway蛋白质组学的质谱优选肽段自动挑选方法，包括以下步骤：A.将目标代谢通路上所有涉及到的蛋白质名称作为关键词，对待研究生物的全蛋白序列进行目标蛋白群的提取；B.对所提取的目标蛋白群按照实验所用的蛋白酶进行理论酶切，产生所有目标蛋白的理论酶切肽段；C.计算所有的理论酶切肽段的理论分子量(Mass)、理论保留时间(NET)、等电点(pI)；D.根据实际设定的理论分子量和等电点筛选符合条件的理论肽段，得到质谱的优选肽段集合，即所有实验中需要重点关注的肽段；该肽段集合及每个肽段的理论保留时间作为在实际实验的每个segment中设定优选肽段的依据。