发明名称 |
一种提高原核生物转录组高通量测序效率的方法 |
摘要 |
本发明提供了一种提高原核生物转录组高通量测序效率的方法。通过使用本发明的探针杂交方法去除rRNA后对样品进行转录组测序,mRNA比例与未处理的对照组以及现有技术相比有明显提高,效果更稳定。本发明的方法中还包括DSN酶处理后的文库,经该处理后mRNA比例进一步得到。对于高通量测序而言,有效数据比例每提高一倍,获得可靠结果所需要的总测序量就可以降低一半,因此该方法可极大的降低原核生物转录组solexa测序的成本。 |
申请公布号 |
CN102533956A |
申请公布日期 |
2012.07.04 |
申请号 |
CN201010600211.0 |
申请日期 |
2010.12.22 |
申请人 |
深圳华大基因科技有限公司;深圳华大基因研究院 |
发明人 |
万成;刘晓;陈利;刘雪莉 |
分类号 |
C12Q1/68(2006.01)I;C40B40/06(2006.01)I |
主分类号 |
C12Q1/68(2006.01)I |
代理机构 |
中国国际贸易促进委员会专利商标事务所 11038 |
代理人 |
罗菊华 |
主权项 |
一种提高原核生物转录组高通量测序效率的方法,所述方法的特征在于提供与原核生物的16s和23s rRNA的保守区域杂交的经过标记的探针,使用所述探针结合rRNA,利用与所述标记特异性结合的分子实体结合探针‑rRNA复合物,从而去除rRNA‑探针复合物而富集mRNA,其后将经处理的RNA用于构建文库。 |
地址 |
518083 广东省深圳市盐田区北山工业区综合楼 |