一种检测地方黄牛AQP9基因单核苷酸多态性的方法

摘要

本发明公开了一种检测黄牛AQP9基因单核苷酸多态性的方法，以包含AQP9基因的待测黄牛全基因组DNA为模板，以特异性引物对P6为引物，PCR扩增黄牛AQP9基因的外显子6区；再对扩增产物片段进行SSCP多态性检测并对产物进行测序分析。由于AQP9基因的功能涉及体重、体高、体长、胸围等生长性状，该发明是一种在DNA水平上筛查和检测与黄牛生长性状密切相关的分子遗传标记，以便用于黄牛肉用生长性状的标记辅助选择(MAS)，快速建立遗传资源优良的黄牛种群。

主权项

一种检测中国地方黄牛AQP9基因的单核苷酸多态性的方法，其特征在于，以中国地方黄牛基因组DNA序列为模板，利用特异性引物对PCR扩增黄牛AQP9基因，然后利用非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳检测产物单链构象多态性，多态产物经测序后即可准确鉴定中国地方黄牛品种AQP9基因的单核苷酸多态性位点为该基因的：g.47575C＞T，47615C＞T，47690A＞G变异位点，黄牛AQP9基因的单核苷酸多态性为：与GenBank acc.No.：NC_007308序列比较，AA基因型对应的SNPs为：g.47575C，47615C，47690A；AB基因型对应的SNPs为：g.47575C/T，47615C/T，47690A/G；BB基因型对应的SNPs为：g.47575T，47615T，47690G；所述的引物对为：上游引物：5′‑AAGGAAGACCAAGCGATGT‑3′  19nt；下游引物：5′‑GTGTGTGAAGATGCTTTGTGA‑3′21nt。