Uso de una variación estructural para analizar diferencias genómicas para la predicción de heterosis

摘要

Un método que comprende: (a) seleccionar una primera planta y una segunda planta, en donde la primera planta y la segunda planta pueden cruzarse para producir una planta progenie fértil que presente un fenotipo relacionado con heterosis en comparación con las plantas parentales; (b) detectar variaciones estructurales de ADN entre un genoma de la primera planta y un genoma de la segunda planta; y, (c) relacionar las variaciones estructurales con el fenotipo relacionado a heterosis usando una estrategia computacional evolucionaria iterada, identificando con ello las variaciones estructurales que predicen el grado esperado del fenotipo relacionado a heterosis en la planta progenie; en donde, en la etapa (b), (i) las variaciones estructurales son detectadas usando un método de hibridación genómica comparativo; o (ii) las variaciones estructurales son variaciones del número de copia.