UGT1A1基因多态性检测的方法及液相芯片

摘要

本发明公开了一种UGT1A1基因多态性检测液相芯片和使用该液相芯片的检测方法，所述液相芯片包括有分别包被有特异的对应野生型和变异型的anti-tag序列的微球，所述anti-tag序列选自针对UGT1A1*28基因型的SEQ ID NO.13和SEQ ID NO.14、针对UGT1A1*6基因型的SEQID NO.9和SEQ ID NO.10、和/或针对UGT1A1*93基因型的SEQ ID NO.11和SEQ IDNO.12，上述每种微球具有不同颜色编码；扩增出具有UGT1A1*28、UGT1A1*6和/或UGT1A1*93基因型的变异目标序列的引物，所述引物具有生物素修饰，以使对应的PCR反应产物含有生物素标记，且所述PCR反应产物具有能与anti-tag互补配对的序列。本发明所提供的检测方法与测序法的吻合率高达100％。所制备的UGT1A1基因多态性检测液相芯片具有非常好的信号-噪声比，并且所设计的探针以及anti-tag序列之间基本上不存在交叉反应。

主权项

一种UGT1A1基因多态性检测液相芯片，其特征是，主要包括有：(1).分别包被有特异的对应野生型和变异型的anti‑tag序列的微球，所述anti‑tag序列选自针对UGT1A1*28基因型的SEQ ID NO.13和SEQ ID NO.14、针对UGT1A1*6基因型的SEQ IDNO.9和SEQ ID NO.10、和/或针对UGT1A1*93基因型的SEQ ID NO.11和SEQ ID NO.12，上述每种微球具有不同颜色编码；(2).扩增出具有UGT1A1*28、UGT1A1*6和/或UGT1A1*93基因型的变异目标序列的引物，所述引物具有生物素修饰，以使对应的PCR反应产物含有生物素标记，且所述PCR反应产物具有能与anti‑tag互补配对的序列；所述扩增引物的碱基序列为针对UGT1A1*28和UGT1A1*6基因型的SEQ ID NO.15及SEQ ID NO.16；和/或针对UGT1A1*93基因型的SEQID NO.17及SEQ ID NO.18；上述每对引物中的一条的末端具有生物素修饰。