一种大通量鉴定苏云金芽孢杆菌毒力基因的方法

摘要

本发明提供了一种基于生物信息学的方法挖掘苏云金芽孢杆菌毒性基因的方法。本发明通过对Bt混合基因组进行测序、数据组装，获得ORFs，与现有功能基因进行比对，鉴定具有同源性的ORFs，再通过基因克隆的方法获得该功能基因，实现了大规模、高通量、经济的新型模式基因的鉴定和挖掘。本方法可以对Bt菌株中所含的基因包括毒性或者毒性相关以及一些功能基因进行挖掘，还可用于对一个地区基因的类型分布的评价。本方法确定的Bt毒力基因可应用于转基因农作物中，使其具备相应抗性，具有重要的应用和经济价值。

主权项

一种高通量鉴定细菌功能基因的方法，包括以下步骤：1)选取在光学显微镜或者扫描电镜下具有伴胞晶体的菌株作为目标菌株，提取质粒和基因组后，混合；2)对混合后的质粒和基因组进行小片段文库测序，将测序数据进行组装，得到测序短序列组装为长的片段重叠群，进而组装为一定长度的片段；3)利用软件分析步骤2)中片段中的开放阅读框ORFs，与生物信息数据库比对进行基因注释，选取与功能基因具有同源性的ORF‑1；4)将步骤3)获得的ORFs‑1与现有菌种的功能基因比对，鉴定出与功能基因具有同源性的ORFs‑2，即鉴定出总基因组中所含的基因类型。