主权项 |
一种基于引物保护解除的甲基化DNA的检测方法,其特征在于,步骤如下:步骤1,用亚硫酸盐处理并纯化待测DNA、标准非甲基化DNA和标准甲基化DNA;步骤2,确定待测基因的检测区域,在所要检测的基因序列中,选择一段含有多个CpG位点的序列作为目标检测序列进行引物设计,以该段序列的5’端的一段序列作为PCR正向引物,以该段序列的3’端的一段序列的互补序列作为PCR反向引物;并将20碱基长度的T7序列加在正向引物的5’端作为T7尾引物序列,将20碱基长度的T3序列加在反向引物的5’端作为T3尾引物序列;合成T7尾引物和T3尾引物,并对T7尾引物进行荧光标记;步骤3,以亚硫酸盐处理过的标准甲基化DNA和非甲基化DNA作为PCR模板, 加入Taq DNA聚合酶和具有3’~5’外切酶活性DNA聚合酶,用所述的正向和反向PCR引物,对亚硫酸盐处理过的待测DNA进行PCR扩增;并以亚硫酸盐处理过的标准非甲基化DNA和标准甲基化DNA作为对照;步骤4,以步骤3所得的PCR产物为模板,以所述T3和荧光标记的T7尾引物进行第二次PCR扩增;步骤5,用核酸分析仪测定步骤4所得PCR扩增产物的DNA片段在毛细管电泳的迁移率;步骤6,将步骤5所测结果与标准DNA样品结果对照,如果待测样品中出现与标准甲基化DNA样品一致的迁移率信号,则存在甲基化DNA;反之,如果待测样品中不出现与标准甲基化DNA样品一致的迁移率信号,则表明待测样品中不存在甲基化DNA。 |