METODO Y APARATO PARA EVALUAR LA AGREGACION DE POLIPEPTIDOS.

摘要

Un método de producción de un polipéptido que tiene una secuencia de aminoácidos, caracterizándose el método por determinar el perfil de una secuencia de aminoácidos introducida para identificar una parte de dicha secuencia de aminoácidos que se predice promueve la agregación de un polipéptido definido por dicha secuencia, comprendiendo el método: determinar una propensión a la agregación para cada aminoácido de dicha secuencia introducida a fin de determinar un perfil de propensión a la agregación para dicha secuencia introducida; y comparar dichas propensiones a la agregación de dicho perfil de propensión a la agregación a fin de determinar una o más partes de dicha secuencia introducida que se predice promueven la agregación; utilizar dichas una o más partes de dicha secuencia introducida que se predice promueven la agregación para diseñar un polipéptido modificado que es más o menos propenso a agregarse o que tiene una propensión a agregarse dentro de un intervalo deseado; y producir luego un polipéptido de acuerdo con el diseño; y en donde dicha determinación comprende determinar, para cada aminoácido de dicha secuencia, un valor de hidrofobicidad, y un valor de propensión a hélice α y/o lámina ß, un valor de carga, y un valor patrón que representa un patrón de aminoácidos hidrófilos y/o hidrófobos en la proximidad de cada aminoácido, multiplicar cada uno de dichos valores por un factor de escalación, y sumar dichos valores escalados para determinar dicha propensión a la agregación.