使用编码的微载体进行的基因组选择和测序

摘要

本发明涉及用于测定靶核酸分子的序列的方法。本文中俘获寡核苷酸探针与编码的微载体连接，其中所述微载体的代码鉴定所述寡核苷酸探针的序列。将俘获寡核苷酸探针与包含核酸分子的样品杂交，其中所述DNA片段包含与俘获寡核苷酸探针的序列互补的序列。测定DNA分子的序列，其中俘获寡核苷酸探针用作DNA聚合酶的引物，在单一分子测序的情况下，其是测序引物。序列测定后，俘获寡核苷酸探针的核苷酸序列通过测定对应于俘获寡核苷酸探针的微载体上的代码来鉴定。该序列信息直接鉴定测序的DNA片段在基因组上的位置，允许直接比对。

主权项

一种用于测定靶核酸分子的序列的方法，所述方法包括以下步骤：a) 提供与编码的微载体连接的俘获寡核苷酸探针，其中所述微载体的代码鉴定所述寡核苷酸探针的序列和/或其在参考基因组上的位置，b) 将所述俘获寡核苷酸探针与包含核酸分子的样品杂交，其中所述核酸分子包含至少部分与俘获寡核苷酸探针的序列互补的序列，c) 通过产生至少2个核苷酸的序列阅读，测定步骤b)的杂交的核酸分子的序列，d) 测定微载体上的代码，e) 鉴定与如步骤d)中所测定的微载体上的代码相对应的俘获寡核苷酸探针的核苷酸序列以及其在参考基因组上的位置，f) 将步骤c)中测定的序列信息与步骤e)中鉴定的信息组合以测定靶核酸分子的序列。