发明名称 两核苷酸同时合成DNA测序方法及其应用
摘要 两核苷酸同时合成DNA测序方法及其应用,待测核酸序列由标记的核苷酸dATP、dGTP、dCTP、dUTP按照一定组合分成三组对同一模板进行三次测序:每组测序由包含四个标记的核苷酸dATP、dGTP、dCTP、dUTP,按照每个核苷酸在一个循环中只使用一次的方式,进行两次由两个不同标记核苷酸同时合成测序反应的循环,每进行一次测序反应得到由核苷酸(碱基)片段构成的一个编码,若干次测序反应后得到由一组若干编码构成的核酸序列信息;当该组测序反应完成后,通过变性将测序引物延伸链清除,重新杂交测序引物,进行下一组测序反应,最后将三组测序反应获得的三组编码信息,通过解码转化成对应的三组核苷酸(碱基)片段信息,并通过比较三组核苷酸(碱基)信息组装出待测核酸序列的具体碱基信息。
申请公布号 CN102329884A 申请公布日期 2012.01.25
申请号 CN201110321795.2 申请日期 2011.10.20
申请人 东南大学 发明人 陆祖宏;肖鹏峰
分类号 C12Q1/68(2006.01)I;C12R1/19(2006.01)N 主分类号 C12Q1/68(2006.01)I
代理机构 南京经纬专利商标代理有限公司 32200 代理人 李纪昌
主权项 一种两核苷酸同时合成DNA测序方法,其特征在于待测核酸序列由标记的核苷酸dATP、dGTP、dCTP和dUTP按照一定组合分成三组对同一模板进行三次测序:其中每组测序由包含四个标记的核苷酸dATP、dGTP、dCTP、dUTP,按照每个核苷酸在一个循环中只使用一次的方式,进行两次由两个不同标记核苷酸同时合成测序反应的循环,每进行一次合成测序反应得到由核酸片段构成的一个编码,核酸片段的编码包括按照核苷酸的标记物和标记物的强度进行,一个序列片段对应一个编码,并用一个专属的符号表示,编码包括单个标记物对应的单个碱基字符、由两个不同标记物构成的两个碱基字符串,称之为母码,表示标记物或者碱基的种类码;以及由标记物强度反映的核苷酸个数构成,称之为子码,表示标记物强度对应的碱基个数码;若干次测序反应后得到由若干个编码构成的核酸序列信息;当该组测序反应完成后,通过变性将测序引物延伸链清除,重新杂交测序引物,进行下一组测序反应;最后将三组测序反应获得的三组编码信息,通过解码转化成对应的三组核苷酸(碱基) 片段信息,并通过比较三组核酸片段信息组装出待测核酸序列的具体碱基信息。
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