用于检测大肠癌的基因组合及其基因芯片

摘要

本发明为用于检测大肠癌的基因组合，该基因组合包括30个基因片段，其中第30种基因片段为质控基因。本发明还提供了应用该基因组的基因芯片。由于现有技术中对于大肠癌的检测只是针对其中一个或几个指标检测，特异性差、灵敏度低、准确率低。本发明针对大肠癌的30个指标设计了30个基因片段，这30个基因片段共同用来检测大肠癌，并且应用基因芯片技术，提供了一种特异性好、灵敏度高、准确率高的检测大肠癌的基因芯片。

主权项

用于检测大肠癌的引物组合，其特征为包括26个引物对，其中的26个引物对分别为：(1)VIP：5’‑CTCCTTGTGCTCCTGAC‑3’和5’‑CTGCTCCTCTTTCCATTC‑3’；(2)C2：5’‑TGCTCCTGGACTGTTCG‑3’和5’‑GCTTCACTCCTGTGGGT‑3’；(3)Survivin：5’‑AGGTGCCTGTTGAATCTG‑3’和5’‑GACGCTTCCTATCACTCTATT‑3’；(4)IL‑2：5’‑AAGACCCAGGGACTT‑3’和5’‑GGTTGCTGTCTCATCA‑3’；(5)Granulysin：5’‑CTGCGTGATGAGGAGAAA‑3’和5’‑GGGTCGCAGCATT‑3’；(6)FAK：5’‑TCCACCAAAGAAACCG‑3’和5’‑TCTGTGCCATCTCAATCT‑3’；(7)IL‑1：5’‑CGCCTGACAGAAACCA‑3’和5’‑GCGAATGACAGAGGGT‑3’；(8)IL‑8：5’‑CAGCCTTCCTGATTTC‑3’和5’‑AACCCTCTGCACCCA‑3’；(9)Cox‑1：5’‑ATCCAGAAACAGTGGCTCG‑3’和5’‑CAACCAATGGCGTG‑3’；(10)C‑myc：5’‑ACGCCGCTCGGAAGGAAT‑3’和5’‑TCCACCGTGACCACATCG‑3’；(11)VEGF：5’‑CCCACCCACATACATACA‑3’和5’‑CCTCCCAACTCAAGTCC‑3’；(12)Stufen：5’‑GCTGCGAAACACGATGCT‑3’和5’‑CTGGGCCAGTCGGCTAAT‑3’；(13)C10orf46：5’‑TTTGGCTCCGCTTTCTCG‑3’和5’‑CTCCCAGTTGTTGTGGTTCT‑3’；(14)Ki‑67：5’‑TTGCCTCCTAATACGC‑3’和5’‑CTTCCGAAGCACCACT‑3’；(15)TOP2B：5’‑GACAATGCCCTCACC‑3’和5’‑CCAGGCTCCTTCTTC‑3’；(16)MTHFR：5’‑ACCGCCGTGAACTACTGT‑3’和5’‑GCCTCCCTCCTCCTCTT‑3’；(17)PCNA：5’‑CAAGGACCTCATCAACG‑3’和5’‑GACTTTCTCCTGGTTTGG‑3’；(18)P15：5’‑TGGACCTGGTGGCTACGAAT‑3’和5’‑GCCGCTAGGGCCTAAGTTGT‑3’；(19)IGF‑1：5’‑TGAAGAACGCAAGTAGAGG‑3’和5’‑AAAGGTTATGAAGGGAGG‑3’；(20)HIF‑1α：5’‑CCAGCAACTTGAGGAA‑3’和5’‑GGTGGGTAATGGAGACA‑3’；(21)CD44：5’‑CTCCTCCCTGTCTACCCT‑3’和5’‑GACCTCCCTTATTTCTATC‑3’；(22)CyclinD2：5’‑ACAGAAGTGCGAAGAAGAGG‑3’和5’‑TGGAGTTGTCGGTGTAAATG‑3’；(23)uPA：5’‑GGAACCCAGACAACCG‑3’和5’‑TGTAGATGGCCGCAAA‑3’；(24)FAP：5’‑GAGTTGCCACCTCTGC‑3’和5’‑AGGCGACCAGCATAA‑3’；(25)DKFZp586G1517：5’‑CACCGCTGCCAATAACT‑3’和5’‑CAAAGCACCTGTCACCC‑3’；(26)P27：5’‑GACCCTCCCAAACCAA‑3’和5’‑AGCGTCAAGGCTTCAGT‑3’。