从无基因组参考序列物种获得基因信息及功能基因的方法

摘要

本发明涉及从无基因组参考序列物种获得基因信息及功能基因的方法。本发明还公开了获得亚洲玉米螟的基因表达谱的方法。本发明还公开了获得亚洲玉米螟的转录组信息及功能基因的方法。本发明首次将DGE-tag技术与RNA-seq技术相结合，用于从无基因组参考序列的物种中获得基因的表达时期、表达量、对应的代谢通路及基因功能信息，所述方法方便、快捷、准确且成本低廉。

主权项

一种从无基因组参考序列物种发掘基因信息的方法，包括：(1)获得待测物种的数字基因表达谱，其中包括基因表达标签的序列及丰度；(2)获得待测物种全基因组转录本的集合，形成序列数据库；(3)将(1)获得的数字基因表达谱中的基因表达标签分别与(2)获得的序列数据库进行比较，找到与该基因表达标签匹配的转录本序列，得到与该基因表达标签相应的基因全长cDNA序列，将该基因全长cDNA序列与已知基因信息的基因序列数据库进行比较和分析，获得该序列对应的基因的潜在功能；同时，根据(1)获得的该基因表达标签丰度获得其对应基因的表达量或表达模式。