用于口蹄疫病毒实时荧光RT-PCR检测的引物和方法

摘要

本发明公开了属于病毒检测技术领域的一种用于口蹄疫病毒实时荧光RT-PCR检测的引物和方法。本发明分析所有已报道的口蹄疫病毒通用型基因组序列，分别设计引物和荧光探针，通过实时荧光RT-PCR检测，得到口蹄疫通用型的特异性荧光曲线，可以确定血清型，检测结果可靠、准确灵敏、操作简单、省时省力、降低检测成本、提高检测效率。

主权项

一种用于口蹄疫病毒实时荧光RT‑PCR检测的引物，其特征在于，所述引物为：上游引物UNFMDVpf1127：5’‑TGGGTTTTACAAACCTGTGATGG‑3’；下游引物UNFMDVpr1221：5’‑CCACGGAGATCAACTTCTCCTG‑3’；上游引物UNFMDVpr1221’：5’‑CAGGAGAAGTTGATCTCCGTGG‑3’；下游引物UNFMDVpf1127’：5’‑CCATCACAGGTTTGTAAAACCCA‑3’；上游引物Hfpf1117：其序列为上游引物UNFMDVpf1127向5’端方向延伸10个碱基得到的碱基序列；下游引物Hfpr1231：其序列为下游引物UNFMDVpr1221向3’端方向延伸10个碱基得到的碱基序列；下游引物Hfpr1211：其序列为下游引物UNFMDVpr1221向5’端方向延伸10个碱基得到的碱基序列；上游引物Hfpf1117’：其序列为上游引物UNFMDVpr1221’向5’端方向延伸10个碱基得到的碱基序列；下游引物Hfpf1231’：其序列为下游引物UNFMDVpf1127’向3’端方向延伸10个碱基得到的碱基序列；下游引物Hfpr1211’：其序列为下游引物UNFMDVpf1127’向5’端方向延伸10个碱基得到的碱基序列；采用上述引物做实时荧光RT‑PCR检测时，引物的配对方案为：上游引物UNFMDVpf1127和下游引物UNFMDVpr1221配对使用；上游引物UNFMDVpr1221’和下游引物UNFMDVpf1127’配对使用；上游引物Hfpf1117和下游引物Hfpr1231配对使用；上游引物Hfpf1117和下游引物Hfpr1211配对使用；上游引物Hfpf1117’和下游引物Hfpr1231’配对使用；上游引物Hfpf1117’和下游引物Hfpr1211’配对使用。