一种快速检测山羊Six6基因单核苷酸多态性的方法及其应用

摘要

本发明公开了一种快速检测山羊同源异型框6(six6)基因单核苷酸多态性(SNP)的方法，以包含Six6基因的待测山羊全基因组DNA为模板，以引物对P为引物，PCR扩增山羊Six6基因；用限制性内切酶PstI消化PCR产物后，再进行琼脂糖凝胶电泳；根据电泳结果鉴定山羊Six6基因第232位的基因型(以序列Accession No.NM_001104993.1为参考)；在动物生产实践中，由于Six6基因单核苷酸变异或SNP对形成胚胎、调控生长激素和促进垂体分泌激素等具有重要的作用，故将该位点不同基因型与生长发育性状数据进行关联分析。结果发现：CT基因型个体的管围显著大于CC基因型个体(P＝0.047)，说明CT基因型可以作为一个提高山羊管围的分子遗传标记。故本发明提供的快速检测Six6基因SNP的检测方法，在山羊生长性状的标记辅助选择(MAS)育种中，有利于快速建立遗传资源优良的山羊种群。

主权项

一种快速检测山羊Six6基因单核苷酸多态性的方法，其特征在于，以包含Six6基因的待测山羊全基因组DNA为模板，以引物对P为引物，PCR扩增山羊Six6基因；用限制性内切酶PstI消化PCR扩增产物之后，再对酶切后的扩增片段进行琼脂糖凝胶电泳；根据琼脂糖凝胶电泳结果鉴定山羊Six6基因第232位的单核苷酸多态性，所述的引物对P为：上游引物：5’TCCTCCAATCCCTCCCG‑3’          17nt；下游引物：5’‑AACATCGAGGCAGCGCCGGCGACTGC‑3’26nt。