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Un método para el control continuo de la amplificación de polinucleótidos, que comprende: (a) combinar una muestra que contiene una secuencia diana, con uno o más cebadores de oligonucleótido complementarios a regiones de la secuencia diana, una enzima de polimerización, sustratos de nucleótido, y un conjugado de oligonucleótido que tiene la formula: en la que MB es un ligando del surco menor, n es 0 o 1, uno de los grupos Fl A y Fl B es un fluoróforo y el otro de los grupos Fl A y Fl B es un apagador, W es un grupo de enlace trivalente, ODN es un oligonucleótido o un oligonucleótido modificado, K es una unión o un grupo de enlace, en donde la secuencia de ODN solapa de 1 a 7 bases con una secuencia de cebador de al menos uno de dichos cebadores y la porción de ODN tiene una secuencia complementaria con una porción de la secuencia diana que se está amplificando, para proporcionar una mezcla; (b) incubar la mezcla bajo condiciones favorables para la polimerización; y (c) controlar en continuo la amplificación controlando la fluorescencia producida al tener lugar la hibridación del conjugado con la diana amplificada.
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