| 发明名称 | 一种适用于基因芯片的倍数法差异基因筛选控制方法 | ||
| 摘要 | 一种用于基因芯片的倍数法差异基因筛选控制方法，包括如下步骤：步骤一：获取基因表达谱数据；步骤二：计算每个基因的倍数差异值，如倍数差异值大于预设倍数，判定为差异基因；步骤三：对倍数值进行对数变换；步骤四：进行正态变换，计算z值；步骤五：对Z<sub>i</sub>值进行z检验，用标准正态分布的理论来推断差异发生的概率p，筛选p<0.01的基因为差异表达基因。本发明利用概率原理、结构更加可靠、有效降低假阳性率。 | ||
| 申请公布号 | CN102080129A | 申请公布日期 | 2011.06.01 |
| 申请号 | CN201010572058.5 | 申请日期 | 2010.12.01 |
| 申请人 | 杭州师范大学 | 发明人 | 吴剑丙;陈喆;王慧中;钱永生 |
| 分类号 | C12Q1/68(2006.01)I | 主分类号 | C12Q1/68(2006.01)I |
| 代理机构 | 杭州天正专利事务所有限公司 33201 | 代理人 | 王兵;王利强 |
| 主权项 | 1.一种用于基因芯片的倍数法差异基因筛选控制方法，包括如下步骤：步骤一：获取基因表达谱数据；步骤二：计算每个基因的倍数差异值，如倍数差异值大于预设倍数，判定为差异基因；其特征在于：所述筛选控制方法还包括以下步骤：步骤三：对倍数值进行对数变换；步骤四：进行正态变换，计算z值，其计算公式为：<img file="442715DEST_PATH_IMAGE001.GIF" wi="120" he="66" />，其中<img file="239157DEST_PATH_IMAGE002.GIF" wi="101" he="97" />，<img file="357155DEST_PATH_IMAGE003.GIF" wi="157" he="111" />；其中，<img file="423069DEST_PATH_IMAGE004.GIF" wi="17" he="25" />为第<img file="299363DEST_PATH_IMAGE005.GIF" wi="9" he="18" />个基因的表达值，<img file="947382DEST_PATH_IMAGE006.GIF" wi="14" he="16" />为芯片基因总数，<img file="501860DEST_PATH_IMAGE007.GIF" wi="17" he="18" />为基因表达的平均值，<img file="868119DEST_PATH_IMAGE008.GIF" wi="16" he="20" />为标准差，<img file="208489DEST_PATH_IMAGE009.GIF" wi="16" he="25" />即是每个基因转换后的z值；步骤五：对<img file="976594DEST_PATH_IMAGE009.GIF" wi="16" he="25" />值进行z检验，用标准正态分布的理论来推断差异发生的概率p，筛选p<0.01的基因为差异表达基因，即该基因表达没有变化发生的概率小于0.01。 | ||
| 地址 | 310036 浙江省杭州市下沙高教园区学林街16号 | ||