发明名称 | 一种组织特异性差异甲基化区域检测方法和系统 | ||
摘要 | 本发明公开一种组织特异性差异甲基化区域tDMR检测方法和系统,该方法包括:通过全基因组测序获得全基因组上单点甲基化信息;根据全基因组上单点甲基化信息基于预选条件确定全基因组上种子tDMR;对种子tDMR向两侧延伸,基于延伸终止条件获得候选tDMR;基于过滤条件对候选tDMR进行过滤获得tDMR结果。本发明的方法和系统能明确全基因组上每一个位点的甲基化状态,在全基因组范围确定tDMR,大大提高了检测效率,降低了成本。经后续验证,本发明找到的tDMR准确率在85%以上,经在多物种中验证(不仅限于哺乳动物),本发明的方法较Vardhman Rakyan等的方法有更高的精确度和敏感度。 | ||
申请公布号 | CN102061337A | 申请公布日期 | 2011.05.18 |
申请号 | CN201010557131.1 | 申请日期 | 2010.11.24 |
申请人 | 深圳华大基因科技有限公司 | 发明人 | 余昶 |
分类号 | C12Q1/68(2006.01)I | 主分类号 | C12Q1/68(2006.01)I |
代理机构 | 中国国际贸易促进委员会专利商标事务所 11038 | 代理人 | 孙宝海 |
主权项 | 一种组织特异性差异甲基化区域tDMR检测方法,其特征在于,包括:通过全基因组测序获得全基因组上单点甲基化信息;根据所述全基因组上单点甲基化信息基于预选条件确定全基因组上种子tDMR;对所述种子tDMR向两侧延伸,基于延伸终止条件获得候选tDMR;基于过滤条件对所述候选tDMR进行过滤,获得tDMR结果。 | ||
地址 | 518083 广东省深圳市盐田区北山工业区综合楼 |