通过功能基因相对表达量鉴别棉花纤维品质的方法

摘要

本发明提供了1项通过功能基因相对表达量鉴别棉花纤维品质的方法，该方法基于功能基因GhCAD6与棉花纤维次生壁发育同步、并且与棉花纤维品质间负相关的理论基础，在开花后15天采集待检测育种材料发育中的纤维样品，通过RT-PCR相对定量法检测该基因在棉花纤维发育时期的相对表达量来鉴别棉花发育中的纤维品质，相对表达量低的即为优良品质的材料。为育种家在品种选育中提供了一种分子选择的可靠依据，可使育种家在棉花纤维发育时期在田间做农艺形状选择的同时，能综合品质因子进行育种材料的选择，也可结合最终品质分析的结果做出决选，提高了选择的准确性。

主权项

通过功能基因相对表达量鉴别棉花纤维品质的方法，其特征在于：所述的功能基因是表达量与棉花纤维次生壁发育同步、纤维品质密切相关的功能基因棉花肉桂醇脱氢酶GhCAD6，该功能基因的相对表达量与棉花纤维品质存在负相关关系；在开花后15天采集纤维样品、采用热硼酸法提取棉花纤维RNA、RNA反转录合成cDNA、采用QuantumRNATM 18S内标相对定量法检测GhCAD6基因的表达量，内标引物与竞争剂的比率为3∶7，相对表达量低的为优质材料；在上述过程中，选择GhCAD6基因序列有别于该基因家族保守序列的特异序列区设计引物，使扩增的基因产物只来自于GhCAD6，该引物序列为GhCAD6‑F：5’ACCCCTCTTCAGTTTGTTACCCC 3’GhCAD6‑R：5’GCTTCCAGCAACATCCACGAC 3’。