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Procedimiento para la fabricación de una molécula de ácido nucleico, que comprende las etapas de a) proporcionar un primer oligonucleótido al menos parcialmente bicatenario que comprende un sitio de reconocimiento para una primera enzima de restricción de tipo IIS que corta fuera de su sitio de reconocimiento y comprendiendo dicho oligonucleótido un saliente monocatenario; b) proporcionar un segundo oligonucleótido al menos parcialmente bicatenario que comprende una modificación que permite al oligonucleótido acoplarse a una superficie, por lo cual el oligonucleótido comprende adicionalmente un sitio de reconocimiento para una segunda enzima de restricción de tipo IIS que corta fuera de su sitio de reconocimiento y comprendiendo dicho segundo oligonucleótido un saliente monocatenario; c) ligar el primer y el segundo oligonucleótidos mediante sus salientes generando un primer producto de ligación; d) inmovilizar el primer producto de ligación en una superficie mediante la modificación proporcionada por el segundo oligonucleótido; e) cortar el primer producto de ligación inmovilizado con la segunda enzima de restricción de tipo IIS liberando de este modo un primer oligonucleótido elongado que tiene un saliente y un segundo oligonucleótido acortado, que permanece unido a la superficie; f) proporcionar un oligonucleótido adicional al menos parcialmente bicatenario que tiene una modificación que permite al oligonucleótido adicional acoplarse de forma específica a una superficie, por lo cual el oligonucleótido contiene un sitio de reconocimiento para una segunda o una adicional enzima de restricción de tipo IIS y un saliente monocatenario que es complementario al saliente del primer oligonucleótido elongado; g) ligar el oligonucleótido adicional al menos parcialmente bicatenario con el primer oligonucleótido elongado mediante sus salientes generando un producto de ligación de segundo nivel; h) cortar el producto de ligación de segundo nivel con la segunda o adicional enzima de restricción de tipo IIS generando de este modo un oligonucleótido elongado de segundo nivel que tiene un saliente y un oligonucleótido adicional acortado; i) inmovilizar el oligonucleótido adicional acortado; j) repetir las etapas f) a i) al menos una vez, generando en la etapa g) un producto de ligación de nivel superior, por lo cual en la última repetición el oligonucleótido adicional entrante comprende un sitio de reconocimiento para una enzima de restricción de tipo IIS que produce tras la escisión un saliente monocatenario idéntico en longitud al saliente generado por la primer enzima de restricción de tipo IIS específica para el primer oligonucleótido y las etapas h) e i) se reemplazan con las etapas k) y l); k) inmovilizar el producto de ligación de nivel superior mediante la modificación proporcionada por el oligonucleótido adicional; y l) cortar el producto de ligación de nivel superior con la enzima de restricción de tipo IIS adicional, dejando la parte del ácido nucleico a fabricar unida al primer oligonucleótido, que se libera preferentemente al sobrenadante y más preferentemente permitiendo su transferencia a un nuevo recipiente de reacción.
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