差异表达基因的检测方法

摘要

本发明提供一种差异表达基因的检测方法，包括如下步骤：确定样本的数量；通过数据读取单元，从基因芯片中获取基因表达值；通过数据转换单元进行数据转换；通过数据处理单元，根据样本的不同条件，按双样本检验单元、单样本检验单元、多样本检验单元进行数据处理；通过分布识别单元进行分析，判断样本检验结果的分布，从而确定p值；通过比较单元判断基因表达值是否存在差异，得到检测结果。本发明检测灵敏度高，假阳性低，有效性好。

主权项

1.一种差异表达基因的检测方法，其特征在于，包括如下步骤：(1)确定样本的数量；所述样本包括病例组样本、对照组样本、或多总体中每个总体的样本；(2)通过数据读取单元，从基因芯片中获取基因表达值；(3)先通过2进制-10进制数据转换单元，再通过以2为底对数的数据转换单元，将所述基因表达值转换成矩阵X_i，其中，矩阵X_i是第1到第k次方矩阵，i表示第i个样本，x表示数据转换后的值，k表示最高原点矩的次数，w表示获取样本的个数；(4)通过数据处理单元进行样本检验；A)当所述样本包括病例组样本和对照组样本时，通过双样本检验单元进行SWang检验，所述SWang检验是指其中，n是病例组样本的数量，m是对照组样本的数量，k是最高原点矩的次数，是病例组样本的基因表达值转换后的原点矩向量，是对照组样本的基因表达值转换后的原点矩向量，D1是病例组样本的基因表达值转换后的从第1次方到第k次方之间离差阵，D2是对照组样本的基因表达值转换后的从第1次方到第k次方之间离差阵；B)当所述样本仅包括病例组样本时，通过单样本检验单元进行SWang检验，所述SWang检验是指其中，S₀是已知分布的原点矩向量；C)当所述样本为多总体样本时，通过多样本检验单元进行SWang检验，所述SWang检验是指其中，d为多总体的数量，d_i为各个总体中的样本数量，sd为d个总体的样本数量之和，sd＝d₁+d₂+…+d_p；(5)通过分布识别单元进行分析，判断样本检验结果的分布，从而确定p值；(6)通过比较单元得到检测结果，当所述p值小于0.05时，则判断所述样本之间的基因表达值存在差异。