基于Hurst指数的DNA序列相似性检测方法

摘要

本发明涉及生物信息处理领域，具体涉及一种基于Hurst指数的DNA序列相似性检测方法，能够同时对多个DNA序列进行相似性检测，简化了计算复杂性，提高了运算效率，并能提高较近进化距离的分析对象间的区别度；包括如下步骤：1)获取不同物种相同功能区域的DNA编码序列作为初始序列；2)对步骤1)所得的初始序列进行数字转换，得到初始序列对应的数值序列；3)对步骤2)所得的每个数值序列通过R/S分析方法获得得到各个数值序列的Hurst指数；4)利用步骤3)所得的Hurst指数构建距离矩阵。5)从步骤4)获得的距离矩阵获得序列相似性信息。

主权项

基于Hurst指数的DNA序列相似性检测方法，其特征在于：包括如下步骤：1)获取不同物种相同功能区域的DNA编码序列作为初始序列；2)对步骤1)所得的初始序列进行数字转换，得到初始序列对应的数值序列；3)对步骤2)所得的每个数值序列通过R/S分析方法获得得到各个数值序列的Hurst指数；4)利用步骤3)所得的Hurst指数构建距离矩阵；5)从步骤4)获得的距离矩阵获得序列相似性信息，即：距离数值越小的Hurst指数对应的DNA编码序列，其对应物种相似性越大，反之，其对应物种相似性越小。