沙门氏菌血清组鉴定靶点的筛选方法

摘要

一种食品安全技术领域的沙门氏菌血清组鉴定靶点的筛选方法，包括如下步骤：获取所有沙门氏菌的基因组DNA序列，按照血清型进行分类，拼接，得长序列，格式化成BLASTN程序文件；从目标血清型中选择一个代表菌株，切割其基因组DNA序列，得到小片段，将所有小片段与该血清型对应的长序列进行比对，选择E值趋近于0的DNA片段；之后将得到的DNA片段与其余血清型对应的长序列分别进行比对，选择最终E值均＞1的DNA片段；以步骤二最终所得DNA片段为模板，设计引物，扩增所有基因组DNA，检测扩增产物；只有属于目标血清型的基因组DNA序列能扩增到特异扩增条带时，则相应DNA片段为目标血清型的特异靶点。本发明的方法实施简便、结果准确，能够提供可靠的特异靶点。

主权项

一种沙门氏菌血清组鉴定靶点的筛选方法，其特征在于，包括如下步骤：步骤一，获取已经测序完成的沙门氏菌的基因组DNA序列，按照沙门氏菌的血清型进行分类，拼接每种血清型下的所有基因组DNA序列，得长序列，利用BLASTN软件格式化成BLASTN程序文件；步骤二，从目标血清型中选择一个代表菌株，切割其基因组DNA序列，得到小片段，将所有小片段与该血清型对应的长序列进行比对，选择E值趋近于0的DNA片段；之后将得到的DNA片段与其余血清型对应的长序列分别进行比对，选择最终E值均＞1的DNA片段；步骤三，以步骤二最终所得DNA片段为模板，设计引物；利用引物扩增每种血清型下对应的所有基因组DNA，检测扩增产物；只有属于目标血清型的基因组DNA序列能扩增到特异扩增条带时，则相应DNA片段为目标血清型的特异靶点。