乳腺癌预后相关基因mRNA表达水平检测液相芯片

摘要

本发明公开了一种乳腺癌预后相关基因mRNA表达水平检测液相芯片，主要包括有：针对不同目标基因的、与胺基修饰的支持探针偶联的微球，每条支持探针主要包括5’端的间隔臂序列和3’端的与支持延伸探针互补配对的特异性序列P1，所述支持探针包括有针对ESR1基因的SEQ.ID NO.1和针对PGR基因的SEQ.ID NO.2；连接支持探针与目标基因mRNA的支持延伸探针，每条支持延伸探针主要包括5’端能与对应的目标基因结合的特异性序列P2、间隔臂序列、3’端能与对应的支持探针的特异性序列P1互补配对的P3序列，所述支持延伸探针的扩增延伸探针，每条扩增延伸探针包括有5’端能与目标基因mRNA结合的特异性序列P4、间隔臂序列、3’端序列P5；或者还包括有与P5序列互补配对的标记探针。本发明所述液相芯片能够在均一的反应条件下进行杂交反应，所设计的探针在检测中特异性好、信噪比高。

主权项

一种乳腺癌预后相关基因mRNA表达水平检测液相芯片，其特征是，主要包括有：(1)针对不同目标基因的、与胺基修饰的支持探针偶联的微球，每条支持探针主要包括5’端的间隔臂序列和3’端的与支持延伸探针互补配对的特异性序列P1，所述支持探针包括有针对ESR1基因的SEQ.ID NO.1和针对PGR基因的SEQ.ID NO.2，每种微球具有不同的荧光编码；(2)连接支持探针与目标基因mRNA的支持延伸探针，每条支持延伸探针主要包括5’端能与对应的目标基因mRNA结合的特异性序列P2、间隔臂序列、3’端能与对应的支持探针的特异性序列P1互补配对的P3序列，所述支持延伸探针的特异性序列P2包括有：针对ESR1基因的选自SEQ.ID NO.24 SEQ.ID NO.28中的2条以上、和针对PGR基因的选自SEQ.ID NO.29 SEQ.ID NO.33中的2条以上；(3)扩增延伸探针，每条扩增延伸探针包括有5’端能与目标基因mRNA结合的特异性序列P4、间隔臂序列、3’端序列P5，3’端还修饰有生物素；所述扩增延伸探针的特异性序列P4包括有：针对ESR1基因的选自SEQ.ID NO.166 SEQ.ID NO.175中的5条以上，和针对PGR基因的选自SEQ.ID NO.176 SEQ.ID NO.185中的5条以上；所述P5为不存在发夹结构，探针内部和探针间不形成二聚体、与P1、P2、P3、P4和总mRNA之间均不存在非特异性结合的序列。