发明名称 一种家禽的保种方法
摘要 一种家禽的保种方法,包括:1)、对家禽初始群体所有个体从血样中提取DNA,并对所有个体所选出的所有微卫星进行PCR扩增,进行电泳各个微卫星位点的基因型;2)、计算出初始群体各个遗传标记位点各个等位基因的频率的平方,计算出初始世代各个遗传位点的初始理论杂合度;3)、以后各个世代所有留种个体都重复步骤1)、2)操作,计算各个遗传位点的实际杂合度;4)、计算出相应世代的各个位点的近交系数值;得到近交系数的卡方检验值,并判断近交系数的显著性;5)、如果判断为显著,计算t世代的近交系数Ft;6)、如果近郊系数Ft高于理论近交系数Ft理,则该代的留种量比上代增加。本发明大大减少工作量、快速性好、可靠性良好。
申请公布号 CN101851678A 申请公布日期 2010.10.06
申请号 CN201010183553.7 申请日期 2010.05.26
申请人 杭州萧山种鸡(萧山鸡)有限公司 发明人 杨福生;任晋东;陈百如
分类号 C12Q1/68(2006.01)I 主分类号 C12Q1/68(2006.01)I
代理机构 杭州天正专利事务所有限公司 33201 代理人 王兵;王利强
主权项 一种家禽的保种方法,其特征在于:所述保种方法包括以下步骤:1)、对家禽初始群体所有个体从血样中提取DNA,并对所有个体所选出的所有微卫星进行PCR扩增,进行电泳各个微卫星位点的基因型;2)、计算出初始群体各个遗传标记位点各个等位基因的频率的平方P0ji2并根据公式(1)计算出初始世代各个遗传位点的初始理论杂合度H0j,公式(1)如下所示: <mrow> <msub> <mi>H</mi> <mrow> <mn>0</mn> <mi>j</mi> </mrow> </msub> <mo>=</mo> <mn>1</mn> <mo>-</mo> <munderover> <mi>&Sigma;</mi> <mrow> <mi>i</mi> <mo>=</mo> <mn>1</mn> </mrow> <mi>m</mi> </munderover> <msubsup> <mi>P</mi> <mrow> <mn>0</mn> <mi>ji</mi> </mrow> <mn>2</mn> </msubsup> <mo>-</mo> <mo>-</mo> <mo>-</mo> <mrow> <mo>(</mo> <mn>1</mn> <mo>)</mo> </mrow> </mrow>H0j为第j个遗传位点的初始世代的杂合度;P0ji2为第j个遗传位点初始世代第i个等位基因频率的平方;m为第j个遗传位点的等位基因数;3)、以后各个世代所有留种个体都重复步骤1)、2)操作,根据公式(3)计算各个遗传位点的实际杂合度Htj,公式(3)如下所示: <mrow> <msub> <mi>H</mi> <mi>tj</mi> </msub> <mo>=</mo> <mfrac> <msub> <mi>D</mi> <mi>tj</mi> </msub> <msub> <mi>N</mi> <mi>t</mi> </msub> </mfrac> <mo>-</mo> <mo>-</mo> <mo>-</mo> <mrow> <mo>(</mo> <mn>3</mn> <mo>)</mo> </mrow> </mrow>Dtj为t世代群体第j个遗传位点上实际的杂合个体数;Nt为t世代的个体数;4)、根据公式(4)计算出相应世代的各个位点的近交系数值,公式(4)如下所示: <mrow> <msub> <mi>F</mi> <mi>tj</mi> </msub> <mo>=</mo> <mfrac> <mrow> <msub> <mi>H</mi> <mrow> <mn>0</mn> <mi>j</mi> </mrow> </msub> <mo>-</mo> <msub> <mi>H</mi> <mi>tj</mi> </msub> </mrow> <msub> <mi>H</mi> <mrow> <mn>0</mn> <mi>j</mi> </mrow> </msub> </mfrac> <mo>-</mo> <mo>-</mo> <mo>-</mo> <mrow> <mo>(</mo> <mn>4</mn> <mo>)</mo> </mrow> </mrow>去除Ftj中的负值后,将所有其他位点计算得到的Ftj相加得到近交系数的卡方检验值,自由度为参加计算的近交系数的个数,根据相应自由度下的卡方分布表判断近交系数的显著性;5)、如果判断为显著,根据公式(5)计算t世代的近交系数Ft,公式(5)如下所示: <mrow> <msub> <mi>F</mi> <mi>t</mi> </msub> <mo>=</mo> <mfrac> <mrow> <munderover> <mi>&Sigma;</mi> <mrow> <mi>j</mi> <mo>=</mo> <mn>1</mn> </mrow> <mi>k</mi> </munderover> <msub> <mi>F</mi> <mi>tj</mi> </msub> </mrow> <mi>k</mi> </mfrac> <mo>-</mo> <mo>-</mo> <mo>-</mo> <mrow> <mo>(</mo> <mn>5</mn> <mo>)</mo> </mrow> </mrow>其中,k为参加计算的位点数;6)、将计算得到的近郊系数Ft与理论近交系数Ft理比较,如果近郊系数Ft高于理论近交系数Ft理,则该代的留种量比上代增加。
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