甘蓝型油菜低亚麻酸分子标记及其制备方法与应用

摘要

本发明属于油菜分子育种技术领域，具体涉及一种与甘蓝型油菜亚麻酸含量紧密连锁的共显性SNP分子标记的制备，及其作为标记在辅助选择低亚麻酸甘蓝型油菜中的应用。用引物扩增低亚麻酸甘蓝型油菜品系甲A254和高亚麻酸甘蓝型油菜品系甲A177基因组DNA，分别得到两个DNA扩增片段，然后对所述4个DNA扩增片段进行克隆、测序、核苷酸序列比对；根据序列的差异，将正向引物和反向引物的3’端的第2个碱基同时进行错配处理，设计了引物对YQ-fad31-1、YQ-fad31-2、YQ-fad32-1和YQ-fad32-2。将引物对YQ-fad31-1、YQ-fad31-2、YQ-fad32-1和YQ-fad32-2进行PCR扩增，PCR扩增和群体检测效果分析，进而得到与甘蓝型油菜低亚麻酸基因连锁的共显性SNP分子标记，本发明为油菜分子育种提供了一种新标记。本发明还第一次将引物3’端错配策略应用于甘蓝型油菜SNP多态性标记的开发和检测，并第一次利用正向引物和反向引物同时错配手段在异源多倍体作物甘蓝型油菜中开发出基于PCR扩增和琼脂糖凝胶电泳SNP标记。同时本发明公开了制备所述分子标记的方法及应用。

主权项

一种甘蓝型油菜低亚麻酸含量的共显性SNP分子标记，它的核苷酸序列如序列表SEQ IDNO：5、SEQ ID NO：6、SEQ ID NO：7和SEQ ID NO：8所示。