一种检测人类DNA修复酶基因多态性的芯片及其制备

摘要

本发明公开了一种检测人类DNA修复酶类基因多态性的玻璃基因芯片，包括经醛基化处理的玻璃片和阵列式排布分布于玻璃基片上的寡核苷酸探针、对照与空白的点涂层，所述点涂层是6条不同位点的DNA修复酶基因特异性检测探针，1条阳性对照，3条阴性对照和空白点样液对照，本发明检测探针与对照探针均以poly(dT)15作为连接臂，并在探针的5’端加入带氨基的六碳基团。本发明还公开了人全血DNA样品扩增的上下游引物设计。本发明的芯片可快速、高效对人类DNA修复酶XRCC1Arg194Trp、Arg399Gln位点和XPDAsp312Asn位点基因多态性进行同步检测，了解机体对内外源因素引起的DNA损伤的修复能力，对判断个体罹患恶性肿瘤的风险和指导肿瘤病人选择合适的化疗药物、实施个体化治疗具有重要的意义。

主权项

一种检测人类DNA修复酶类基因多态性的玻璃基因芯片，包括玻璃基片和阵列式分布于玻璃基片上的寡核苷酸探针与对照及空白的点涂层，其中，所述的玻璃基片是经醛基化处理的玻璃片，所述的寡核苷酸探针是6条不同位点的DNA修复酶基因特异性检测探针，所述的对照是1条阳性对照探针和3条阴性对照探针，所述的空白是空白点样液对照；其特征在于：所述的6条不同位点的DNA修复酶基因特异性检测探针的基因序列分别是：(XRCC1-194)-w：5’-(NH2)-(CH2)6-Pol(dT)15-AAGAAGTCGGCCTAGTTG；(XRCC1-194)-m：5’-(NH2)-(CH2)6-Pol(dT)15-AAGAAGTCGAGGTAGTTG；(XRCC1-399)-w：5’-(NH2)-(CH2)6-Pol(dT)15-ACGGGAGGGTCTCCATT；(XRCC1-399)-m：5’-(NH2)-(CH2)6-Pol(dT)15-ACGGGAGGGCCTCCATT；(XPD-312)-w：5’-(NH2)-(CH2)6-Pol(dT)15-CACGACGGGTTGCTTCA；(XPD-312)-m：5’-(NH2)-(CH2)6-Pol(dT)15-CACGACGGGCTGCTTCA；所述1条阳性对照探针的基因序列是：β-actin：5’-(NH2)-(CH2)6-Pol(dT)15-TACTCTAACCGTACCGA；所述3条阴性对照探针的基因序列分别是：(XRCC1-194)CK：5’-(NH2)-(CH2)6-Pol(dT)15-AAGAAGTCGCGGTAGTTG；(XRCC1-399)CK：5’-(NH2)-(CH2)6-Pol(dT)15-ACGGGAGGGGCTCCATT；(XPD-312)CK：5’-(NH2)-(CH2)6-Pol(dT)15-CACGACGGGGTGCTTCA；上述每种探针与对照及空白分别以2×2方式在玻璃基片表面阵列排布4个平行的点涂层，每个点涂层的直径为0.15mm，同种探针或对照或空白点涂层间距为0.4mm，不同探针或对照点涂层间距为0.8mm；芯片点涂层阵列总面积为3.5mm×6mm。