一种CYP3A4基因SNP检测特异性引物、液相芯片及方法

摘要

本发明公开了CYP3A4基因SNP检测特异性引物、液相芯片和方法，所述液相芯片包括针对每种型别的突变位点分别设计的野生型和突变型ASPE引物对、分别包被有特异的anti-tag序列的微球，和用于扩增具有CYP3A4*1B、CYP3A4*2、CYP3A4*3、CYP3A4*4、CYP3A4*5、CYP3A4*6、CYP3A4*15、CYP3A4*17、CYP3A4*18和/或CYP3A4*19SNP位点的CYP3A4基因目标序列的引物。所制备的CYP3A4基因SNP检测液相芯片具有非常好的信号-噪声比，并且所设计的探针以及anti-tag序列之间基本上不存在交叉反应。本发明设计的ASPE引物具有非常好的特异性，能准确区分各种类型的突变位点。所述检测方法步骤简单，十种SNP位点可以一步检测完成，操作方便，并且避免了多次操作过程中存在的诸多不确定因素，因而可大大提高检测准确率。

主权项

一种CYP3A4基因SNP检测液相芯片，其特征在于：主要包括有：(1)针对每种型别的SNP位点分别设计的野生型和突变型ASPE引物对，每种ASPE引物对由5’端的tag序列和3’端的针对目的基因SNP位点的特异性引物序列组成，所述特异性引物序列分别选自：SEQ ID NO.21及SEQ ID NO.22、SEQ ID NO.23及SEQ ID NO.24、SEQ ID NO.25及SEQID NO.26、SEQ ID NO.27及SEQ ID NO.28、SEQ ID NO.29及SEQ ID NO.30、SEQ ID NO.31及SEQ ID NO.32、SEQ ID NO.33及SEQ ID NO.34、SEQ ID NO.35及SEQ ID NO.36、SEQ IDNO.37及SEQ ID NO.38、和SEQ ID NO.39及SEQ ID NO.40中的一对或多对；所述tag序列选自SEQ ID NO.1～SEQ ID NO.20中的序列；(2)分别包被有特异的anti-tag序列的微球，所述anti-tag序列能相应地与(1)中所选tag序列互补配对，所述anti-tag序列选自SEQ ID NO.41～SEQ ID NO.60中的序列；(3)用于扩增具有CYP3A4*1B、CYP3A4*2、CYP3A4*3、CYP3A4*4、CYP3A4*5、CYP3A4*6、CYP3A4*15、CYP3A4*17、CYP3A4*18和CYP3A4*19中的一个或多个SNP位点的CYP3A4基因目标序列的引物。