发明名称 |
一种染色体同线性同源区域的检测方法和系统 |
摘要 |
本发明适用于基因工程领域,提供了一种染色体同线性同源区域的检测方法和系统,所述方法包括下述步骤:将参考基因集中的参考基因定位到目标基因组上,形成基因拷贝座位;根据所述基因拷贝座位,将重叠的基因拷贝聚类到一起,形成模糊位点基因代表座位;根据所述模糊位点代表基因座位,利用动态规划模糊位点定位算法检测染色体的同线性同源区域。本发明实施例提供的染色体同线性同源区域的检测方法可自动检测到染色体同线性同源区域,且敏感度高,复杂度低,避免了目测时主观因素对染色体同线性同源区域检测的影响。 |
申请公布号 |
CN101794346A |
申请公布日期 |
2010.08.04 |
申请号 |
CN200910252465.5 |
申请日期 |
2009.12.11 |
申请人 |
深圳华大基因研究院;深圳华大基因科技有限公司 |
发明人 |
白寅琪;李瑞强;王俊;杨焕明;汪建 |
分类号 |
G06F19/00(2006.01)I;C12Q1/68(2006.01)I |
主分类号 |
G06F19/00(2006.01)I |
代理机构 |
中国国际贸易促进委员会专利商标事务所 11038 |
代理人 |
孙宝海 |
主权项 |
一种染色体同线性同源区域的检测方法,其特征在于,所述方法包括下述步骤:将参考基因集中的参考基因定位到与染色体对应的目标基因组上,形成基因拷贝座位;根据所述基因拷贝座位,将重叠的基因拷贝聚类到一起,形成模糊位点基因代表座位;根据所述模糊位点代表基因座位,利用动态规划模糊位点定位算法检测染色体的同线性同源区域。 |
地址 |
518083 广东省深圳市盐田区北山工业区综合楼 |