石斑鱼类线粒体基因组高变异区扩增引物及其设计方法

摘要

石斑鱼类线粒体基因组高变异区扩增引物及其设计方法，涉及一对PCR引物(名称为G-dloop)，提供一对可高效扩增大多数石斑鱼类线粒体基因组高变异区的扩增引物及其设计方法。扩增引物由两条单链寡聚核苷酸组成。登陆Genebank搜索脊椎动物线粒体DNA细胞色素b基因及16S rRNA基因序列的高保守区，经同源比对，获得一对扩增引物，通过长PCR方法扩增获32种石斑鱼类的目的片段并进行测序。使用同源比对软件Clustal X 1.83对所得序列进行比对，找出32种石斑鱼类线粒体基因组细胞色素b5’端及12S rRNA 3’端的保守序列，并利用简并性原则，设计出石斑鱼类线粒体基因组高变异区扩增引物。

主权项

石斑鱼类线粒体基因组高变异区扩增引物，其特征在于由两条单链寡聚核苷酸组成，其中轻链引物GL-dloop有22个碱基：CAG AGC GCC GGT CTT GTA AAC C，位于tRNA-Thr基因上，重链引物GH-dloop有21个碱基：GTC AGG ACC AAR CCT TTG TGC，其中R为简并碱基，代表碱基A或G，位于12SrRNA基因3’起始端。