人工基因调控网络的模拟方法

摘要

本发明公开了一种人工基因调控网络的模拟方法，该方法步骤如下：A、根据真实基因调控网络的拓扑特性，构建具有全局稳定不动点的骨架网络；B、将骨架网络中的节点和边进行随机拆分；C、在骨架网络上增加新的节点：D、在新的节点的上产生新的边；E、设定模拟的网络规模，网络中包含R个节点，重复步骤C-D，产生新的节点和新的边，使人工基因调控网络增大，每重复一次，统计一次网络的节点数，直到网络增大到设定的网络规模为止。该方法具有很强的针对性和生物信息学应用性；模拟产生的人工基因调控网络具有动力学稳定性；为基因调控网络构建算法的性能测试提供了多样化人工基因调控网络，为系统生物领域的研究人员提供了新的基因网络模拟工具。

主权项

一种人工基因调控网络的模拟方法，其特征在于，该方法步骤包括如下：A、构建具有全局稳定不动点的骨架网络；B、将骨架网络中的节点和边进行随机拆分：将骨架网络中的节点和边进行随机拆分为m0个节点随机均分为l个子集，每个子集中均有m01，m02，...，m0l个节点和e01，e02，...，e0l条边；C、在骨架网络上增加新的节点：将一个新节点被随机分配到l个子集中的其中一个子集中，随着新节点的加入，子集中将产生m条边，其中m≤Min(m01，m02，...，m0l)；D、在新的节点的基础上产生新的边；E、设定模拟的网络规模为，网络中包含R个节点，重复步骤C-D，在骨架网络上产生新的节点和新的边，使人工基因调控网络增大，每重复一次，统计一次网络的节点数，网络增大到设定的网络规模为止。