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Sistema y procedimiento de detección de nanopartículas magnéticas mediante magnetoencefalografía. Sistema de detección de nanopartículas magnéticas mediante magnetoencefalografía que comprende un magnetoencefalógrafo 1 con un apantallamiento externo 2 y medios de vibración mecánica de la muestra de tejido biológico, no rotativos, y configurados para que la modulación en amplitud del campo magnético producido por las nanopartículas sea detectable por dicho magnetoencefalógrafo 1, donde los medios de vibración comprenden un primer émbolo 3, no metálico, conteniendo una muestra de tejido biológico con o sin nanopartículas magnéticas y situado dentro del apantallamiento 2 propio del magnetoencefalógrafo 1; y donde dicho primer émbolo 3 está conectado mediante un tubo 4 del mismo material a un segundo émbolo externo 5, actuado por unos medios de accionamiento configurados para regular la frecuencia de la vibración mecánica de la muestra contenida en el primer émbolo 3.
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