发明名称 一种染色体22q11.2区微缺失、微重复的测定方法
摘要 本发明属于生物工程领域,公开了一种染色体22q11.2区微缺失、微重复的测定方法。该方法的步骤包括:抽提基因组DNA;进行多重荧光定量PCR复合扩增,复合扩增体系中包括了5个STR标记:D22S873,22D_5_1,22D_4_5,2D_4_4,22D_4_3和一个内参G6PDH;取PCR扩增产物变性使双链产物转化为可为毛细管电泳分析的单链,采用毛细管电泳对上述变性产物进行产物长度和产物量分析;采用量比值分析的方法和/或采用峰的位置及数量分析的方法判断是否为正常、微缺失或微重复。该方法可提高检测的可靠性,缩短检测时间,降低检测成本,便于临床大规模使用。
申请公布号 CN101555528A 申请公布日期 2009.10.14
申请号 CN200910118941.4 申请日期 2009.03.09
申请人 南京市妇幼保健院 发明人 许争峰;易龙
分类号 C12Q1/68(2006.01)I 主分类号 C12Q1/68(2006.01)I
代理机构 南京天华专利代理有限责任公司 代理人 徐冬涛;刘成群
主权项 1、一种染色体22q11.2区微缺失、微重复的测定方法,其特征在于该方法包括下列步骤:a.抽提基因组DNA;b.多重荧光定量PCR复合扩增:复合扩增体系中包括了5个STR标记:D22S873,22D_5_1,22D_4_5,22D_4_4,22D_4_3和一个内参G6PDH;进行PCR扩增;c.取PCR扩增产物变性使双链产物转化为可为毛细管电泳分析的单链,采用毛细管电泳对上述变性产物进行产物长度和产物量分析;d.结果分析:1)根据下列公式计算量比值:<img file="A2009101189410002C1.GIF" wi="1281" he="149" />量比值0.7~1.3为正常二倍体个体;量比值小于0.7为存在微缺失的个体;量比值大于1.3为存在微重复的个体;和/或2)根据峰的位置和数量进行判断,微缺失为在相应位置缺少峰;微重复有三种情形:相应位置出现峰高等于或接近1∶1∶1的三个峰、出现峰高等于或接近2∶1的二个峰、出现峰高等于或接近1∶2的二个峰;其中:D22S873的上游引物序列为SEQ ID NO.1,下游引物序列为SEQ ID NO.2;22D_5_1的上游引物序列为SEQ ID NO.3,下游引物序列为SEQ ID NO.4;22D_4_5的上游引物序列为SEQ ID NO.5,下游引物序列为SEQ ID NO.6;22D_4_4的上游引物序列为SEQ ID NO.7,下游引物序列为SEQ ID NO.8;22D_4_3的上游引物序列为SEQ ID NO.9,下游引物序列为SEQ ID NO.10;G6PDH的上游引物序列为SEQ ID NO.11,下游引物序列为SEQ ID NO.12。
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