核酸扩增用引物设计装置、引物设计程序、以及引物设计服务器装置

摘要

本发明提供一种能够设计在核酸扩增反应中不会因为引物与计划之外场所结合而产生不需要的核酸片段的适当的引物的引物设计装置、引物设计程序、以及引物设计服务器装置。该引物设计程序用于使计算机进行用于扩增核酸中多个序列的一系列引物的决定处理，对于从多个应该扩增部位选择两个部位时的所有组合，计算与两个部位中的一个部位有关的候补引物的序列和在两个部位中的另一个部位得到的扩增产物的序列的互补性，决定用于扩增核酸中多个序列的一系列引物。

主权项

1. 一种引物设计装置，用于设计用来对核酸中的多个部位进行扩增的一系列引物，其中，具有：(I)输入部，其用于输入包括用于计算候补引物和扩增产物的互补性的计算指令A的处理指令；(II)处理部，其用于接收所述计算指令A，对于从多个应该扩增部位选择两个部位时的所有组合，计算与所述两个部位中的一个部位有关的所述候补引物的序列和在所述两个部位中的另一个部位得到的所述扩增产物的序列的互补性并进行评分，通过进行包括上述处理的处理，来决定用于扩增所述多个部位的一系列的引物；(III)存储部，其用于至少储存：由多个所述候补引物构成的候补引物组且与所述多个应该扩增部位的每个对应的候补引物组的数据、由多个所述扩增产物构成的扩增产物组且所述多个扩增产物的每个能够在所述应该扩增部位的每个通过使用了所述候补引物的扩增反应而得到的扩增产物组的数据、通过所述处理部计算得到的所述互补性的结果、以及通过所述处理部决定的所述一系列的引物；和(IV)输出部，其用于输出由所述处理部决定的所述一系列引物。