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Es handelt sich um ein Verfahren zur Erstellung von Proteinprofilen und zur Erfassung von Expressionsmustern einer Zelle in einem vom Menschen oder Tier stammenden Gewebe mittels Bildverarbeitung, wobei sich die Proteinprofile und die Expressionsmuster entlang eines Differenzierungsprozesses der Zelle in dem Gewebe räumlich und/oder quantitativ erfassen lassen, wobei das Gewebe eine mittels mindestens eines Struktur- und mindestens eines Funktionsmarkers markierte Gewebeprobe ist, die getrennt voneinander in mindestens zwei zueinander parallel stehenden und anhand des mindestens einen Strukturmarkers markierten Bereichen des Gewebes zueinander ausrichtbaren Schnittebenen betrachtet und ausgemessen wird und wobei in jeder Schnittebene ein von den oder der anderen Schnittebene unterschiedlicher Funktionsmarker gemessen wird.
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