在人实体瘤中的基因缺损和突变体ALK激酶

摘要

根据本发明，现已在人实体瘤，例如非小细胞肺癌(NSCLC)中鉴定了新的涉及第2号染色体的基因缺失和易位，其导致结合部分间变性淋巴瘤激酶(ALK)激酶与部分二级蛋白质的融合蛋白。二级蛋白质包括棘皮动物微管结合蛋白样4(EML-4)和TRK-融合基因(TFG)。保留ALK酪氨酸激酶活性的EML4-ALK融合蛋白被证实可以驱动以这种突变为特征的NSCLC的增殖和存活。因此，本发明部分地提供了分离的多核苷酸和载体，其编码所披露的突变体ALK激酶多肽，用于检测它的探针，分离的突变体多肽，重组多肽，以及用于检测融合和截短的多肽的试剂。所披露的这种新融合蛋白的鉴定使得可以用新方法来确定在生物样品中这些突变体ALK激酶多肽的存在，本发明还提供了对抑制蛋白质的化合物进行筛选的方法，以及对以突变体多核苷酸或多肽为特征的癌症的进展进行抑制的方法。

主权项

1. 一种分离的多核苷酸，包含核苷酸序列，所述核苷酸序列至少95％相同于选自由下述组成的组的序列：(a)编码棘皮动物微管结合蛋白样4/间变性淋巴瘤激酶(EML4-ALK)融合多肽的核苷酸序列，所述融合多肽包括SEQID NO：1或SEQ ID NO：18的氨基酸序列；(b)编码EML4-ALK融合多肽的核苷酸序列，所述核苷酸序列包括SEQ ID NO：2或SEQ ID NO：19的核苷酸序列；(c)编码EML4-ALK融合多肽的核苷酸序列，所述融合多肽包括EML-4的N端氨基酸序列(SEQ ID NO：3的残基1-233或SEQ ID NO：3的残基)以及ALK的激酶结构域(SEQID NO：5的残基1116-1383)；(d)包括EML-4的N端核苷酸序列(SEQ ID NO：4的核苷酸1-700或SEQ ID NO：4的核苷酸1-1486)以及ALK的激酶结构域核苷酸序列(SEQ ID NO：6的核苷酸3348-4149)的核苷酸序列；(e)包括围绕EML4-ALK融合多核苷酸的融合接头(SEQID NO：2的核苷酸700-701或SEQ ID NO：19的核苷酸1486-1487)的至少6个邻接核苷酸的核苷酸序列；(f)编码包括围绕EML4-ALK融合多肽的融合接头(SEQID NO：1的残基233-234或SEQ ID NO：18的残基495-496)的至少6个邻接氨基酸的多肽的核苷酸序列；以及(g)互补于(a)-(f)的任何核苷酸序列的核苷酸序列。