一种高效的小分子干扰RNA设计的方法

摘要

本发明提出一种高效的小分子干扰RNA设计的方法。主要是应避免选择5’和3’端非编码区(UTR)和起始密码区；应根据基因的mRNA，选择其AUG起始密码子下游50-100nt区域处的编码序列；在此区域，应寻找AA(N19)或TTAA(N21)样序列，GC含量应在30％-70％之间，最好为50％；分析基因可能的二级结构，针对基因的保守区和二级结构松散区设计小分子干扰RNA，并在国际基因组库中比对，确定它们的序列不干扰其它的基因。对设计好的小分子干扰RNA末尾的核苷酸进行脱氧修饰，一方面使其合成成本更低，稳定性更高，在体内更好得抵御核酶的攻击。该方法可以用来设计各种高效的小分子干扰RNA。

主权项

1、一种高效的小分子干扰RNA设计的方法，主要是应避免选择5’和3’端非编码区(UTR)和起始密码区；应根据基因的mRNA，选择其AUG起始密码子下游50--100nt区域处的编码序列；在此区域，应寻找AA(N19)或TTAA(N21)样序列，GC含量应在30％-70％之间，最好为50％。