DNA阵列上的高通量基因组测序

摘要

本发明涉及使用散布在靶标多核苷酸中的衔接头来获得靶标序列的核苷酸序列信息的方法和组合物。该序列信息可以是新的，例如对未知核酸测序、再测序或者基因型分裂。本发明优选地包括在靶标多核苷酸或者多核苷酸片段内的间隔位置上插入多个衔接头的方法。这样的衔接头可以充当平台，用于通过不同的测序化学法，例如那些通过引物延伸、探针连接等来鉴别核苷酸的测序化学法来起到询问邻近的序列的测序化学法。本发明涵盖这样的方法和组合物，用于将已知的衔接头序列插入靶标序列，使得连续的靶标序列被衔接头所中断。通过对衔接头的“上游”和“下游”两者测序，可以完成整个靶标序列的鉴定。

主权项

1. 鉴定在包含多个检测位置的靶标序列的一个检测位置上的第一核苷酸的方法，所述方法包含：(a)提供多个多联体，其中每个多联体包含多个单体，每个单体包含：i)所述靶标序列的第一靶标域，其包含第一组靶标检测位置；ii)第一衔接头，其包含IIs型内切核酸酶限制位点；iii)所述靶标序列的第二靶标域，其包含第二组靶标检测位置；和iv)第二散在衔接头，其包含IIs型内切核酸酶限制位点；(b)鉴定所述第一核苷酸。