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Un método para la detección e identificación de variantes en E6 HPV16, que comprende los pasos de: (a) Tener una muestra biológica que se sospeche tiene infección por HPV16. (b) Proporcionar un par de primers bidireccionales dirigidos hacia partes específicas en la región E6 de HPV16 que amplifican un fragmento de 562 pb; (c) Realización de una reacción para amplificar el DNA derivado de la muestra usando el par de primers; (d) detección del DNA de HPV 16 de los productos de la amplificación de la muestra; (e) identificación específica de 73 variantes diferentes en el gen E6 HPV16. Un método para la detección e identificación de variantes en E6 HPV16, que comprende los pasos de: (a) Tener una muestra biológica que se sospeche tiene infección por HPV16; (b) Proporcionar una diversidad de primers bidireccionales internos dirigidos hacia partes específicas en la región E6 que amplifican fragmentos de 367pb, 362pb y 167pb del DNA de E6 de HPV16 (c) Realización de diferentes reacciones de amplificación para amplificar el DNA derivado de la muestra usando la diversidad de primers; y (d) detección del DNA de HPV16 de los productos de la amplificación de la muestra; (e) identificación específica de 73 variantes diferentes en el gen E6 HPV16. Un método de acuerdo a las reivindicaciones 1 y 2, en donde los pares de primers bidireccionales comprenden primers que son colectivamente complementarios a una primera región consenso del DNA de E6 de HPV16, y los cuales además comprenden primers que son colectivamente substancialmente complementarios a una segunda región consenso del DNA de E6 de HPV16. Un método de acuerdo a la reivindicación 3, en donde la primera y segunda regiones consenso están en el ORF E6 de HPV 16. Un método de acuerdo a la reivindicación 4, en donde los primers están descritos y definidos en la FIG.1. Un método de acuerdo a la reivindicación 5, en donde uno de cada par de primers es marcado con biotina Un método de acuerdo a las reivindicaciones 1 y 2 en donde el paso (d) se lleva a cabo por la hibridización de los productos amplificados con una diversidad de sondas específicas de E6 de HPV16. Un método de acuerdo a la reivindicación 7, donde las sondas específicas son complementarias a secuencias de DNA de E6 HPV16 entre el nucleótido 28 y el nucleótido 580 de E6 de HPV16.
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