用于鉴别和确认基因组靶点以及药物筛选的分子信标成像的方法和应用

摘要

本发明公开了一种用于鉴定生命体的细胞样品中基因表达的方法，其中所述的细胞样品以一个或多个标记物序列为特征。在一个实施方案中，此方法包括下列步骤：提供一种或多种类型的分子信标，每类分子信标均设计为具有与一个或多个标记物序列之一互补的相应探针序列和一个能发射单一颜色的光子的发射器，因此当其中一类分子信标靶向细胞样品中的一个或多个标记物序列之一时，分子信标的发射器发射单一颜色的光子，从而产生单一颜色的光子信号；用一种或多种类型分子信标处理细胞样品；和检测细胞样品的一个或多个颜色的光子信号以鉴定细胞样品的基因表达，其中所述的一种或多种类型的分子信标设计为一个或多个颜色的光子信号不需信号放大即可检测。

主权项

1. 从生命体的细胞样品中鉴定生命体响应药物处理、干涉、或疾病状态的基因表达的方法，其中所述细胞样品含有至少一个以癌症标记物序列为特征的癌细胞，包含下列步骤:a. 提供细胞样品；b. 用分子信标处理所述的细胞样品，其中每个分子信标都是具有茎-环发夹结构的单链寡核苷酸，所述的单链寡核苷酸是在茎-环发夹结构的一个末端具有荧光基团而在另一个末端具有淬灭剂从而被双标记，并且具有与所述癌症标记物序列互补的探针序列；c. 从所述的细胞样品获得第一组荧光信号；d. 药物处理、干涉或疾病状态后从所述细胞样品中获得第二组荧光信号；e. 比较所述第一组荧光信号和所述第二组荧光信号以确定这些荧光信号的水平或强度的变化；和f. 使用这些荧光信号水平或强度的变化来评价与生命体有关的疾病进程、减轻、治疗效果、或开发新疗法，其中所述的分子信标设计为所述的第一组荧光信号和所述的第二组荧光信号不需信号放大即可检测。