发明名称 |
一种基因注释语义相似度的计算方法 |
摘要 |
本发明提供了一种基因注释语义相似度的计算方法。这种方法通过基因本体协会提供的基因本体关联文件,将基因与基因本体结点建立关联。然后先计算基因本体结点的语义相似度,最后根据基因本体结点语义相似度计算基因注释语义相似度。本发明的有益效果在于:可以自动地、大批量地计算基因注释语义相似度。 |
申请公布号 |
CN101359349A |
申请公布日期 |
2009.02.04 |
申请号 |
CN200810040050.7 |
申请日期 |
2008.07.01 |
申请人 |
上海大学 |
发明人 |
吴飞珍;马文丽;王妹;陈启龙;郑文岭;姚文娟;施国明 |
分类号 |
G06F19/00(2006.01) |
主分类号 |
G06F19/00(2006.01) |
代理机构 |
上海上大专利事务所(普通合伙) |
代理人 |
何文欣 |
主权项 |
1.一种基因注释语义相似度的计算方法,其特征在于从基因本体gene ontology,GO网站http://www.geneontology.org下载基因关联文件和GO文件,根据基因关联文件将基因名称与GO结点之间建立关联;然后先计算GO结点的语义相似度,最后计算基因注释语义相似度。 |
地址 |
200444上海市宝山区上大路99号 |