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Esta solicitud proporciona composiciones y métodos para monitorear y regular la produccion de un producto blanco de una vía bioquímica en un organismo, tal como butanol. Un gen que codifica una molécula de un informante emisor de luz, tal como luciferasa, se une operativamente a una secuencia de nucleotidos reguladora de la transcripcion que regula la transcripcion de una enzima en la vía que senaliza la velocidad de produccion del producto blanco, tal como butanol deshidrogenasa. Cuando un microorganismo es transfectado con dicha construccion de informante y cultivado, el informante se expresa contemporáneamente con la enzima. La cantidad de luz producida por el informante indica la cantidad de enzima producida, la cual, a su vez, senaliza la cantidad de producto blanco que se está produciendo. Cuando el informante se mide en tiempo real, se proporciona informacion que se puede usar para regular las condiciones de cultivo y optimizar la produccion del producto blanco. Reivindicacion 45: Software que comprende: un codigo que recibe informacion sobre el estado de una célula o un cultivo celular, un codigo que determina si se deben cambiar las condiciones de cultivo, y de qué manera, a fin de optimizar la produccion blanco, y un codigo que transmite instrucciones sobre el cambio de las condiciones de cultivo. Reivindicacion 51: Una composicion que comprende sustancialmente butanol y que contiene componentes de traza de amaranto, sorgo dulce o ambos, y que está sustancialmente libre de subproductos del petroleo. Reivindicacion 52: Un método comercial que comprende: a) crear una joint venture entre al menos una primera empresa que produce células sometidas a bioingeniería que elaboran un biocombustible y una segunda empresa del área de la refinacion de petroleo; b) administrar la joint venture donde: i) la primera empresa proporciona una licencia sobre cepas bacterianas sometidas a bioingeniería de las cuales es propietaria y que producen un biocombustible; ii) la segunda empresa patrocina la investigacion y el desarrollo en la joint venture dirigidos a la produccion de biocombustible; y iii) y la segunda empresa adquiere el biocombustible producido por la joint venture.
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