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"ANáLISE DA ASSINATURA DE IDENTIFICAçãO DE GENES (GIS) PARA MAPEAMENTO DE TRANSCRITOS". Um método de mapeamento de transcritos de acordo com uma concretização da invenção é descrito e combina eficiência, com base em etiquetas (SAGE e MPSS) curtas, com a precisão de comprimento total cDNA (flcDNA) para uma caracterização compreensiva de transcritomas. Este método também é denominado análise da Assinatura Identificadora de Genes (GIS). Neste método, inicialmente se extraem a extremidades 5<39> e 3<39> dos clones de cDNA de comprimento total para dentro de uma estrutura de ditag (dupla etiqueta), com os concatâmeros de ditag sendo subseqüentemente colocados em seqüência de uma maneira eficiente, e finalmente mapeados para o genoma para definição da estrutura de genes. Como uma ditag de GIS representa as extremidades 5<39> e 3<39> de um transcrito ele é mais informativo do que etiquetas de SAGE e MPSS. é possível obter trechos de segmentos entre os pares de etiquetas 5<39> e 3<39>, incluindo orientação, ordenação e família de cromossomos para o mapeamento eficiente de transcritos e identificação do sítio dos genes. Ainda, utiliza-se uma seleção de sufixos comprimidos (CSA) para indexar a seqüência de genomas a fim de agilizar o mapeamento e reduzir os requisito de memória dos computadores.
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