鸭肠炎病毒基因组DNA的提取及其序列

摘要

本发明公开了一种鸭肠炎病毒(Duck Enteritis Virus，DEV)基因组DNA的提取方法和基因组序列。首先利用高渗缓冲液裂解感染DEV的鸡胚成纤维细胞(CEF)，然后加入核酸酶消化细胞DNA，再用酚/氯仿抽提的方法获得病毒基因组DNA。将所得样品随机打断为2.0～2.5kb片段，连接入pUC19载体，转化宿主大肠杆菌构建基因组文库。对文库中的阳性克隆进行随机测序，测序总长度对病毒基因组的覆盖率为6倍。测序结果经拼接和组装，获得了全长为156512bp的DEV全基因组序列，分析发现基因组结构与α－疱疹病毒亚科水痘病毒属成员一致，为DEV的分类提供了理论依据。

主权项

1.鸭肠炎病毒基因组DNA序列，其特征在于，全部核苷酸序列长度为156512 bp，至少编码78个开发阅读框，基因编码的氨基酸序列与α-亚科疱疹病毒具有同源性，其中5个基因仅与目前所知的禽疱疹病毒有同源性，基因组结构与水痘病毒属相一致，该序列为：SEQ NO.1。