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La presente se refiere a un método de secuenciacion alelo-específica en cualquier gen que involucra el conocimiento de los SNP existentes dentro de dicho gen, y en particular, aquellos SNP que son fenotípicamente significativos para una afeccion dada. Reivindicacion 1: Un método de secuenciacion alelo-específico que comprende: (a) obtener una muestra de ensayo que comprende una molécula de ácido nucleico a secuenciar; (b) exponer dicha molécula de ácido nucleico a al menos un cebador alelo- específico que está adaptado para unirse en su ultima base 3'; a al menos un sitio SNP seleccionado dentro de dicha molécula; (c) proveer condiciones apropiadas para que tenga lugar la transcripcion por la cual se produce una hebra complementaria de dicho ácido nucleico a partir de dicho sitio SNP seleccionado en adelante; (d) secuenciar dicha hebra complementaria con el fin de determinar la existencia de otros SNP conocidos; y, opcionalmente, (e) utilizar esta informacion de secuencia para determinar el haplotipo de dicho individuo.
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