发明名称 工业上有用的微生物
摘要 根据本发明,能够提供具有比野生型大肠杆菌的染色体DNA短470kbp以上的染色体DNA的大肠杆菌突变体,该大肠杆菌突变体在经过一定时间的培养后,菌体数比野生型株多,据此通过将该突变体在培养基中进行培养,使之在培养物中生成、蓄积有用物质,能够很有效率地制备有用物质,例如:蛋白质、肽、氨基酸、核酸、维生素、糖、有机酸以及脂类等。
申请公布号 CN101115832A 申请公布日期 2008.01.30
申请号 CN200580047094.7 申请日期 2005.11.25
申请人 协和发酵工业株式会社 发明人 沟口宽;原清敬;森英郎
分类号 C12N15/09(2006.01);C12N1/20(2006.01);C12N1/21(2006.01);C12P7/64(2006.01);C12P13/00(2006.01);C12P13/04(2006.01);C12P17/00(2006.01);C12P19/00(2006.01);C12P19/30(2006.01);C12P19/38(2006.01);C12P21/02(2006.01) 主分类号 C12N15/09(2006.01)
代理机构 中国国际贸易促进委员会专利商标事务所 代理人 罗菊华
主权项 1.含有下述[1]和[2]所述基因或者与它们同源的基因、且具有比野生型大肠杆菌短470kbp以上的染色体DNA的大肠杆菌突变体,不过、在下述[1]和[2]所述的基因或者与它们同源的基因中,存在野生型大肠杆菌原来不具有的基因(以下称为NC基因)的情况下,该源自野生型大肠杆菌的上述大肠杆菌突变体也可以不具有NC基因,其中所述[1]和[2]所述基因如下:[1]thrA基因、thrB基因、thrC基因、talB基因、mog基因、htgA基因、dnaK基因、dnaJ基因、hokC基因、nhaA基因、nhaR基因、rpsT基因、ribF基因、ileS基因、lspA基因、fkpB基因、lytB基因、dapB基因、carA基因、carB基因、caiF基因、caiE基因、caiD基因、caiC基因、caiB基因、caiA基因、caiT基因、fixA基因、fixB基因、fixC基因、fixX基因、kefC基因、folA基因、apaH基因、apaG基因、ksgA基因、pdxA基因、surA基因、imp基因、djlA基因、rluA基因、hepA基因、polB基因、araD基因、araA基因、araB基因、araC基因、tbpA基因、leuD基因、leuC基因、leuB基因、leuA基因、leuL基因、leuO基因、ilvI基因、ilvH基因、fruR基因、ftsL基因、ftsI基因、murE基因、murF基因、mraY基因、murD基因、ftsW基因、murG基因、murC基因、ddlB基因、ftsQ基因、ftsA基因、ftsZ基因、lpxC基因、secA基因、mutT基因、yacE基因、guaC基因、hofC基因、hofB基因、ppdD基因、nadC基因、ampD基因、ampE基因、aroP基因、pdhR基因、aceE基因、aceF基因、lpdA基因、acnB基因、speD基因、speE基因、gcd基因、hpt基因、yadF基因、panD基因、panC基因、panB基因、htrE基因、ecpD基因、folK基因、pcnB基因、dksA基因、sfsA基因、ligT基因、hrpB基因、ponB基因、hemL基因、pfs基因、dgt基因、htrA基因、dapD基因、glnD基因、map基因、rpsB基因、tsf基因、smb基因、rrf基因、dxr基因、rth基因、cdsA基因、yaeL基因、hlpA基因、lpxD基因、fabZ基因、lpxA基因、lpxB基因、rnhB基因、dnaE基因、accA基因、ldcC基因、mesJ基因、rof基因、cutF基因、proS基因、rcsF基因、abc基因、dniR基因、gloB基因、rnhA基因、dnaQ基因、up18基因、gmhA基因、pepD基因、gpt基因、crl基因、phoE基因、proB基因、proA基因、hemB基因、proC基因、aroL基因、aroM基因、araJ基因、sbcC基因、sbcD基因、phoB基因、phoR基因、brnQ基因、proY基因、malZ基因、queA基因、tgt基因、secD基因、secF基因、tsx基因、ribD基因、ribH基因、nusB基因、thiL基因、pgpA基因、dxs基因、ispA基因、xseB基因、thiI基因、thiJ基因、apbA基因、cyoE基因、cyoD基因、cyoC基因、cyoB基因、cyoA基因、ampG基因、bolA基因、tig基因、clpP基因、clpX基因、lon基因、hupB基因、cof基因、mdlA基因、mdlB基因、glnK基因、amtB基因、tesB基因、maa基因、hha基因、acrB基因、acrA基因、acrR基因、aefA基因、priC基因、apt基因、dnaX基因、recR基因、htpG基因、adk基因、hemH基因、aes基因、gsk基因、fsr基因、ushA基因、cueR基因、gcl基因、gip基因、purK基因、purE基因、ybbF基因、ppiB基因、cysS基因、folD基因、sfmA基因、sfmC基因、sfmD基因、sfmH基因、sfmF基因、fimZ基因、entD基因、fepA基因、fes基因、entF基因、fepE基因、fepC基因、fepG基因、fepD基因、fepB基因、entC基因、entE基因、entB基因、entA基因、cstA基因、dsbG基因、ahpC基因、ahpF基因、rnk基因、rna基因、citT基因、citG基因、citX基因、citF基因、citE基因、citD基因、citC基因、citA基因、citB基因、dcuC基因、dcuC基因、crcA基因、cspE基因、crcB基因、lipA基因、lipB基因、dacA基因、rlpA基因、mrdB基因、mrdA基因、phpB基因、nadD基因、holA基因、rlpB基因、leuS基因、lnt基因、phoL基因、ubiF基因、asnB基因、nagD基因、nagC基因、nagA基因、nagB基因、nagE基因、glnS基因、fur基因、fldA基因、seqA基因、pgm基因、potE基因、speF基因、kdpE基因、kdpD基因、kdpC基因、kdpB基因、kdpA基因、phrB基因、end8基因、abrB基因、gltA基因、sdhC基因、sdhD基因、sdhA基因、sdhB基因、sucA基因、sucB基因、sucC基因、sucD基因、farR基因、hrsA基因、cydA基因、cydB基因、tolQ基因、tolR基因、tolA基因、tolB基因、pal基因、nadA基因、pnuC基因、czcD基因、aroG基因、gpmA基因、galM基因、galK基因、galT基因、galE基因、modF基因、modE基因、modA基因、modB基因、modC基因、bioA基因、bioB基因、bioF基因、bioC基因、bioD基因、uvrB基因、moaA基因、moaB基因、moaC基因、moaD基因、moaE基因、rhlE基因、dps基因、ompX基因、mipB基因、moeB基因、moeA基因、mdfA基因、grxA基因、poxB基因、aqpZ基因、cspD基因、clpA基因、infA基因、aat基因、cydC基因、cydD基因、trxB基因、lrp基因、ftsK基因、lolA基因、serS基因、dmsA基因、dmsB基因、dmsC基因、pflA基因、pflB基因、focA基因、serC基因、aroA基因、cmk基因、rpsA基因、himD基因、msbA基因、lpxK基因、kdsB基因、smtA基因、mukF基因、kicA基因、mukB基因、aspC基因、ompF基因、asnS基因、pncB基因、pepN基因、ssuB基因、ssuC基因、ssuD基因、ssuA基因、ssuE基因、pyrD基因、uup基因、pqiA基因、pqiB基因、rmf基因、fabA基因、ompA基因、sulA基因、helD基因、mgsA基因、acyP基因、hyaA基因、hyaB基因、hyaC基因、hyaD基因、hyaE基因、hyaF基因、appC基因、appB基因、appA基因、csgG基因、csgF基因、csgE基因、csgD基因、csgB基因、csgA基因、csgC基因、sfaA基因、mdoG基因、mdoH基因、msyB基因、htrB基因、solA基因、dinI基因、pyrC基因、grxB基因、rimJ基因、mviM基因、mviN基因、flgN基因、flgM基因、flgA基因、flgB基因、flgC基因、flgD基因、flgE基因、flgF基因、flgG基因、flgH基因、flgI基因、flgJ基因、flgK基因、flgL基因、rne基因、rluC基因、rpmF基因、plsX基因、fabH基因、fabD基因、fabG基因、acpP基因、fabF基因、pabC基因、tmk基因、holB基因、ptsG基因、fhuE基因、nagZ基因、ndh基因、mfd基因、ycfU基因、ycfV基因、ycfW基因、cobB基因、potD基因、potC基因、potB基因、potA基因、pepT基因、phoQ基因、phoP基因、purB基因、trmU基因、icdA基因、minE基因、minD基因、minC基因、clyA基因、umuD基因、umuC基因、dsbB基因、nhaB基因、fadR基因、dadA基因、dadX基因、ldcA基因、mltE基因、tagl基因、treA基因、dhaR基因、pth基因、prsA基因、ychB基因、hemM基因、hemA基因、prfA基因、hemK基因、kdsA基因、chaA基因、chaB基因、chaC基因、narL基因、narX基因、narK基因、narG基因、narH基因、narJ基因、narI基因、tpr基因、purU基因、sprE基因、galU基因、hns基因、tdk基因、adhE基因、oppA基因、oppB基因、oppC基因、oppD基因、oppF基因、cls基因、kch基因、tonB基因、trpA基因、trpB基因、trpC基因、trpD基因、trpE基因、trpL基因、btuR基因、sohB基因、topA基因、cysB基因、acnA基因、ribA基因、pgpB基因、pyrF基因、osmB基因、rnb基因、envM基因、sapF基因、sapD基因、sapC基因、sapB基因、sapA基因、aldH基因、ordL基因、goaG基因、pspF基因、pspA基因、pspB基因、pspC基因、pspD基因、pspE基因、sucP基因、ompG基因、tyrR基因、tpx基因、mppA基因、fnr基因、ogt基因、dbpA基因、intR基因、lar基因、recT基因、recE基因、racC基因、kil基因、sieB基因、racR基因、dnaC基因、enpP基因、trkG基因、VMTH_LAMBD基因、VLOM_LAMBD基因、tnpO基因、upo3基因、ompN基因、nifJ基因、hslJ基因、ldhA基因、feaR基因、feaB基因、tynA基因、paaZ基因、paaA基因、paaB基因、paaC基因、paaD基因、paaE基因、paaF基因、paaG基因、paaH基因、paaI基因、paaJ基因、paaK基因、paaX基因、paaY基因、acpD基因、hrpA基因、aldA基因、gapC基因、gapC基因、cybB基因、trg基因、rimL基因、tehA基因、tehB基因、prtC基因、potA基因、potC基因、ansP基因、nhoA基因、narV基因、narW基因、narY基因、narZ基因、narU基因、fdnG基因、fdnH基因、fdnI基因、adhP基因、sfcA基因、rpsV基因、osmC基因、dos基因、xasA基因、gadB基因、pqqL基因、chuR基因、hipA基因、hipB基因、tam基因、uxaB基因、marC基因、marR基因、marA基因、marB基因、dcp基因、lycV基因、dicA基因、dicB基因、rspB基因、rspA基因、speG基因、dmsB基因、dmsC基因、bioD基因、mlc基因、asr基因、ebr基因、pntB基因、pntA基因、arcD基因、rstA基因、rstB基因、tus基因、fumC基因、fumA基因、manA基因、uidC基因、uidB基因、uidA基因、uidR基因、hdhA基因、malI基因、malX基因、malY基因、add基因、blr基因、nth基因、gst基因、pdxY基因、tyrS基因、pdxH基因、slyB基因、slyA基因、sodC基因、nemA基因、gloA基因、rnt基因、lhr基因、sodB基因、araJ基因、purR基因、cfa基因、ribE基因、ag43基因、phsC基因、nrfC基因、pykF基因、lpp基因、sufS基因、aroD基因、ppsA基因、aroH基因、nlpC基因、btuD基因、btuE基因、btuC基因、himA基因、pheT基因、pheS基因、pheM基因、rplT基因、rpmI基因、infC基因、thrS基因、arp基因、pfkB基因、cedA基因、katE基因、celF基因、celD基因、celC基因、celB基因、celA基因、osmE基因、nadE基因、spy基因、astE基因、astB基因、astD基因、astA基因、cstC基因、xthA基因、gdhA基因、topB基因、selD基因、sppA基因、ansA基因、tdh基因、gapA基因、ttuC基因、caiT基因、rnd基因、fadD基因、slp基因、pabB基因、sdaA基因、manX基因、manY基因、manZ基因、rrmA基因、cspC基因、kdgR基因、tcmA基因、htpX基因、prc基因、pqiB基因、pphA基因、holE基因、exoX基因、ptrB基因、purT基因、eda基因、edd基因、zwf基因、pykA基因、mlt基因、znuA基因、znuC基因、ruvB基因、ruvA基因、ruvC基因、ntpA基因、aspS基因、bisZ基因、torY基因、cutC基因、argS基因、pgsA基因、amn基因、cbl基因、nac基因、erfK基因、cobT基因、cobS基因、cobU基因、gyrI基因、phsE基因、sbcB基因、hisL基因、hisG基因、hisD基因、hisC基因、hisB基因、hisH基因、hisA基因、hisF基因、hisI基因、wzz基因、ugd基因、gnd基因、galF基因、wcaM基因、wcaL基因、wcaK基因、wzxC基因、wcaJ基因、cpsG基因、cpsB基因、wcaI基因、wcaH基因、wcaG基因、gmd基因、wcaF基因、wcaE基因、wcaD基因、wcaC基因、wcaB基因、wcaA基因、wzb基因、wza基因、asmA基因、dcd基因、udk基因、thiD基因、thiM基因、mrp基因、metG基因、cdd基因、sanA基因、mglC基因、mglA基因、mglB基因、galS基因、folE基因、cirA基因、lysP基因、nfo基因、fruA基因、fruK基因、fruB基因、rplY基因、narP基因、ccmH基因、dsbE基因、ccmF基因、ccmE基因、ccmD基因、ccmC基因、ccmB基因、ccmA基因、napC基因、napB基因、napH基因、napG基因、napA基因、napD基因、napF基因、eco基因、alkB基因、ada基因、apbE基因、rcsB基因、rcsC基因、atoS基因、atoC基因、atoD基因、atoA基因、atoE基因、atoB基因、gyrA基因、ubiG基因、nrdA基因、nrdB基因、inaA基因、glpQ基因、glpT基因、glpA基因、glpB基因、glpC基因、cinA基因、ais基因、pmrD基因、menE基因、menC基因、menB基因、menD基因、menF基因、nuoN基因、nuoM基因、nuoL基因、nuoK基因、nuoJ基因、nuoI基因、nuoH基因、nuoG基因、nuoF基因、nuoE基因、nuoD基因、nuoB基因、nuoA基因、lrhA基因、ackA基因、pta基因、ubiX基因、purF基因、dedE基因、dedD基因、folC基因、accD基因、dedA基因、truA基因、usgl基因、pdxB基因、div基因、fabB基因、ddpX基因、mepA基因、aroC基因、sixA基因、fadL基因、vacJ基因、dsdC基因、dsdX基因、dsdA基因、emrY基因、emrK基因、evgA基因、evgS基因、bifF基因、ddg基因、glk基因、mntH基因、nupC基因、gltX基因、xapR基因、xapB基因、xapA基因、lig基因、zipA基因、cysZ基因、cysK基因、ptsH基因、ptsI基因、gsr基因、pdxK基因、cysM基因、cysA基因、cysW基因、cysU基因、cysP基因、ucpA基因、ptbA基因、amiA基因、hemF基因、cchA基因、eutC基因、eutB基因、eutH基因、eutG基因、eutJ基因、eutE基因、cchB基因、eutI基因、talA基因、tktB基因、aegA基因、narQ基因、acrD基因、dapE基因、purC基因、nlpB基因、dapA基因、gcvR基因、bcp基因、hyfA基因、hyfB基因、hyfC基因、hyfD基因、hyfE基因、hyfF基因、hyfG基因、hyfH基因、hyfI基因、hyfJ基因、hyfR基因、focB基因、perM基因、yfgE基因、uraA基因、upp基因、purM基因、purN基因、ppk基因、ppx基因、guaA基因、guaB基因、xseA基因、hisS基因、gcpE基因、ndk基因、pbpC基因、sseA基因、sseB基因、pepB基因、fdx基因、hscA基因、hscB基因、iscU基因、iscS基因、iscR基因、suhB基因、csiE基因、dgxA基因、dgxB基因、hcaC基因、hcaB基因、hcaD基因、glyA基因、hmpA基因、glnB基因、purL基因、acpS基因、pdxJ基因、recO基因、era基因、rnc基因、lepB基因、lepA基因、rseC基因、rseB基因、rseA基因、rpoE基因、nadB基因、srmB基因、ung基因、trx2基因、pssA基因、kgtP基因、clpB基因、rluD基因、pheL基因、pheA基因、tyrA基因、aroF基因、rplS基因、trmD基因、rimM基因、rpsP基因、ffh基因、grpE基因、recN基因、smpA基因、smpB基因、gabD基因、gabT基因、gabP基因、nrdF基因、emrR基因、emrA基因、emrB基因、gshA基因、csrA基因、alaS基因、oraA基因、recA基因、mltB基因、hypF基因、hydN基因、ascG基因、ascF基因、ascB基因、hycI基因、hycH基因、hycG基因、hycF基因、hycE基因、hycD基因、hycC基因、hycB基因、hycA基因、hypA基因、hypB基因、hypC基因、hypD基因、hypE基因、fhlA基因、mutS基因、prpB基因、rpoS基因、pcm基因、surE基因、ygbB基因、ygbP基因、ygbQ基因、cysC基因、cysN基因、cysD基因、iap基因、cysH基因、cysI基因、cysJ基因、ptpS基因、eno基因、pyrG基因、mazG基因、chpR基因、relA基因、barA基因、gud2基因、gudT基因、mioC基因、syd基因、sdaB基因、exo基因、fucO基因、fucA基因、fucP基因、fucI基因、fucK基因、fucU基因、fucR基因、gcvA基因、nifS基因、mltA基因、amiC基因、argA基因、thyA基因、lgt基因、ptsP基因、mutH基因、tas基因、aas基因、galR基因、lysA基因、lysR基因、araE基因、kduD基因、kduI基因、lysS基因、prfB基因、recJ基因、dsbC基因、xerD基因、fldB基因、up14基因、bglA基因、gcvP基因、gcvH基因、gcvT基因、visC基因、ubiH基因、pepP基因、serA基因、rpiA基因、iciA基因、sbm基因、argK基因、fba基因、pgk基因、epd基因、tktA基因、speB基因、speA基因、metK基因、galP基因、sprT基因、endA基因、gshB基因、yqgF基因、ansB基因、mutY基因、mltC基因、nupG基因、speC基因、pitB基因、gsp基因、hybG基因、hybF基因、hybE基因、hybD基因、hybC基因、hybB基因、hybA基因、hoxK基因、exbD基因、exbB基因、metC基因、exsA基因、sufI基因、plsC基因、parC基因、parE基因、icc基因、tolC基因、ribB基因、glgS基因、rfaE基因、glnE基因、cca基因、bacA基因、folB基因、ttdA基因、ttdB基因、ygjD基因、rpsU基因、dnaG基因、rpoD基因、aer基因、ebgR基因、ebgA基因、ebgC基因、fadH基因、uxaA基因、uxaC基因、exuT基因、exuR基因、tdcE基因、tdcD基因、tdcC基因、tdcB基因、tdcA基因、tdcR基因、sohA基因、agaR基因、agaZ基因、agaV基因、agaW基因、agaA基因、agaS基因、agaY基因、agaB基因、agaC基因、agaD基因、agaI基因、mtr基因、deaD基因、nlpI基因、pnp基因、rpsO基因、truB基因、rbfA基因、infB基因、nusA基因、argG基因、secG基因、mrsA基因、folP基因、ftsH基因、ftsJ基因、greA基因、dacB基因、yhbZ基因、rpmA基因、rplU基因、ispB基因、nlp基因、murA基因、yrbI基因、yrbK基因、rpoN基因、ptsN基因、ptsO基因、mtgA基因、arcB基因、gltB基因、nanT基因、npl基因、nanR基因、dcuD基因、sspB基因、sspA基因、rpsI基因、rplM基因、hhoA基因、hhoB基因、mdh基因、argR基因、tldD基因、rng基因、mreD基因、mreC基因、mreB基因、accB基因、accC基因、panF基因、prmA基因、fis基因、aroE基因、smg基因、smf基因、def基因、fmt基因、sun基因、trkA基因、mscL基因、zntR基因、rplQ基因、rpoA基因、rpsD基因、rpsK基因、rpsM基因、rpmJ基因、secY基因、rplO基因、rpmD基因、rpsE基因、rplR基因、rplF基因、rpsH基因、rpsN基因、rplE基因、rplX基因、rplN基因、rpsQ基因、rpmC基因、rplP基因、rpsC基因、rplV基因、rpsS基因、rplB基因、rplW基因、rplD基因、rplC基因、rpsJ基因、tufA基因、fusA基因、rpsG基因、rpsL基因、fkpA基因、slyX基因、slyD基因、kefB基因、prkB基因、crp基因、argD基因、pabA基因、fic基因、ppiA基因、nirB基因、nirD基因、nirC基因、cysG基因、php基因、trpS基因、gph基因、rpe基因、dam基因、damX基因、aroB基因、aroK基因、hofQ基因、mrcA基因、pckA基因、envZ基因、ompR基因、greB基因、feoA基因、feoB基因、bioH基因、gntT基因、malQ基因、malP基因、malT基因、rtcA基因、rtcB基因、rtcR基因、glpR基因、glpG基因、glpE基因、glpD基因、glgP基因、glgA基因、glgC基因、glgX基因、glgB基因、asd基因、gntU基因、gntU基因、gntK基因、gntR基因、ggt基因、ugpQ基因、ugpC基因、ugpE基因、ugpA基因、ugpB基因、livF基因、livG基因、livM基因、livH基因、livK基因、livJ基因、rpoH基因、ftsX基因、ftsE基因、ftsY基因、atzN基因、nikA基因、nikB基因、nikC基因、nikD基因、nikE基因、pitA基因、uspB基因、uspA基因、prlC基因、gor基因、arsR基因、arsB基因、arsC基因、slp基因、hdeB基因、hdeA基因、hdeD基因、gadA基因、treF基因、kdgK基因、dctA基因、dppF基因、dppD基因、dppC基因、dppB基因、dppA基因、tag基因、bisC基因、cspA基因、glyS基因、glyQ基因、xylB基因、xylA基因、xylF基因、xylG基因、xylH基因、xylR基因、bax基因、malS基因、avtA基因、lyx基因、sgbH基因、sgbU基因、sgbE基因、aldB基因、selB基因、selA基因、mtlA基因、mtlD基因、mtlR基因、lldP基因、lldR基因、lldD基因、cysE基因、gpsA基因、secB基因、grxC基因、tdh基因、kbl基因、htrL基因、rfaD基因、rfaF基因、rfaC基因、rfaL基因、rfaK基因、rfaZ基因、rfaY基因、rfaJ基因、rfaI基因、rfaB基因、rfaS基因、rfaP基因、rfaG基因、rfaQ基因、kdtA基因、kdtB基因、mutM基因、rpmG基因、rpmB基因、radC基因、dfp基因、dut基因、ttk基因、pyrE基因、rph基因、dinD基因、gmk基因、rpoZ基因、spoT基因、spoU基因、recG基因、gltS基因、nlpA基因、uhpT基因、uhpC基因、uhpB基因、uhpA基因、ilvN基因、ilvB基因、ivbL基因、emrD基因、ibpB基因、ibpA基因、gyrB基因、recF基因、dnaN基因、dnaA基因、rpmH基因、rnpA基因、yidC基因、thdF基因、tnaL基因、tnaA基因、tnaB基因、bglB基因、bglF基因、bglG基因、phoU基因、pstB基因、pstA基因、pstC基因、pstS基因、glmS基因、glmU基因、atpC基因、uncD基因、atpG基因、atpA基因、atpH基因、atpF基因、atpE基因、atpB基因、atpI基因、gidB基因、gidA基因、mioC基因、asnC基因、pssR基因、ilvL基因、ilvG基因、ilvM基因、ilvE基因、ilvD基因、ilvA基因、ilvY基因、ilvC基因、ppiC基因、rep基因、gppA基因、rhlB基因、trxA基因、rhoL基因、rho基因、rfe基因、wzzE基因、nfrC基因、rffD基因、rffG基因、rffH基因、rffA基因、wzxE基因、rffT基因、wecG基因、aslB基因、aslA基因、hemY基因、hemX基因、hemD基因、hemC基因、cyaA基因、cyaY基因、dapF基因、xerC基因、uvrD基因、corA基因、radD基因、pldA基因、recQ基因、pldB基因、metR基因、metE基因、udp基因、ubiE基因、aarF基因、tatC基因、tatD基因、rfaH基因、ubiD基因、ubiB基因、fadA基因、fadB基因、pepQ基因、trkH基因、trkH基因、hemG基因、mobB基因、mobA基因、dsbA基因、polA基因、yihA基因、hemN基因、ntrC基因、ntrB基因、glnA基因、fdhE基因、fdoI基因、fdoH基因、fdoG基因、fdhD基因、sodA基因、kdgT基因、cpxA基因、cpxR基因、cpxP基因、pfkA基因、sbp基因、cdh基因、tpiA基因、fpr基因、glpX基因、glpK基因、glpF基因、menG基因、menA基因、hslU基因、hslV基因、ftsN基因、cytR基因、priA基因、rpmE基因、metJ基因、metB基因、metL基因、metF基因、katG基因、gldA基因、talC基因、ppc基因、argE基因、argC基因、argB基因、argH基因、oxyR基因、udhA基因、trmA基因、btuB基因、murI基因、murB基因、birA基因、coaA基因、tufB基因、secE基因、nusG基因、rplK基因、rplA基因、rplJ基因、rplL基因、rpoB基因、rpoC基因、htrC基因、thiH基因、thiG基因、thiS基因、thiF基因、thiE基因、thiC基因、rsd基因、hemE基因、nfi基因、hupA基因、hydH基因、hydG基因、purD基因、purH基因、metA基因、aceB基因、aceA基因、aceK基因、arp基因、iclR基因、metH基因、pepE基因、lysC基因、pgi基因、ubiC基因、ubiA基因、plsB基因、dgkA基因、lexA基因、dinF基因、qor基因、dnaB基因、alr基因、tyrB基因、napA基因、hobH基因、uvrA基因、ssb基因、soxS基因、soxR基因、acs基因、nrfA基因、nrfB基因、nrfC基因、nrfD基因、nrfE基因、nrfF基因、nrfG基因、gltP基因、fdhF基因、alsR基因、rpiB基因、proP基因、basS基因、basR基因、adiY基因、adi基因、melR基因、melA基因、melB基因、fumB基因、dcuB基因、dcuR基因、dcuS基因、lysU基因、cadA基因、cadB基因、cadC基因、cutA3基因、cutA2基因、cutA基因、dcuA基因、aspA基因、fxsA基因、groES基因、groEL基因、efp基因、ecnB基因、sugE基因、blc基因、ampC基因、frdD基因、frdC基因、frdB基因、frdA基因、genX基因、psd基因、yjeQ基因、yjeE基因、amiB基因、mutL基因、miaA基因、hfq基因、hflX基因、hflK基因、hflC基因、purA基因、vacB基因、sgaE基因、rpsF基因、priB基因、rpsR基因、rplI基因、fklB基因、cycA基因、cpdB基因、cysQ基因、msrA基因、chpS基因、chpB基因、ppa基因、fbp基因、mpl基因、pmbA基因、cybC基因、nrdG基因、nrdD基因、treC基因、treB基因、treR基因、mgtA基因、pyrI基因、pyrB基因、pyrBI基因、argI基因、valS基因、holC基因、xerB基因、idnR基因、idnT基因、idnO基因、idnD基因、idnK基因、fecE基因、fecD基因、fecC基因、fecB基因、fecA基因、fecR基因、fecI基因、dnaC基因、dnaT基因、bglJ基因、fhuF基因、rsmC基因、holD基因、rimI基因、prfC基因、osmY基因、deoC基因、deoA基因、deoB基因、deoD基因、lplA基因、smp基因、serB基因、radA基因、nadR基因、slt基因、trpR基因、gpmG基因、rob基因、creA基因、creB基因、creC基因、creD基因、arcA基因、lasT基因、thrL基因;[2]acrE基因、argT基因、artI基因、artJ基因、artM基因、artP基因、artQ基因、bfr基因、chiA基因、chpA基因、dacC基因、deoR基因、dinG基因、elaA基因、elaB基因、elaC基因、elaD基因、envD基因、envR基因、fhuA基因、fhuB基因、fhuC基因、fhuD基因、folX基因、glnH基因、glnP基因、glnQ基因、gltJ基因、gltK基因、gltL基因、gspA基因、gspC基因、gspD基因、gspE基因、gspI基因、gspJ基因、gspK基因、gspL基因、hisJ基因、hisM基因、hisP基因、hisQ基因、hofD基因、hofF基因、hofG基因、hofH基因、ltaA基因、mdaA基因、mdaB基因、pinO基因、potF基因、potG基因、potH基因、potI基因、pshM基因、ptwB基因、ptwC基因、rhsB基因、rimK基因、xylU基因。
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