组合化学集中库设计与优化方法

摘要

一种组合化学集中库设计与优化方法，是对一种虚拟组合化学集中库软件包的设计、建立与评价优化的方法。包括第一步以靶标为基础设计虚拟组合初步筛选库；第二步建立虚拟组合初步筛选库并对分子构象进行优化；第三步对虚拟组合初步筛选库进行评价及其优化。本发明采用遗传算法与组合化学方法相结合，可以用于基于大分子靶标三维结构的全新药物的设计和研究。对靶标具有比较高的亲和性，多样性和类药性。具有速度快、费用低、不耗费任何实验器材，完全通过计算模拟的方法来完成组合化学集中库的设计和优化。

主权项

1.一种组合化学集中库设计与优化方法，是对一种虚拟组合化学集中库软件包的设计、建立与评价优化的方法，其特征在于方法步骤包括：<1>首先设计以靶标为基础的虚拟组合初步选库，包括：确定组合合成针对的靶标蛋白；设计组合合成路线，挑选组合构建单元；再选定组合合成中的各基本构建单元的单元构件集合；<2>第二步根据上述的设计，建立虚拟组合初步筛选库，包括：依据十六大类固相合成反应，从指定构造单元中读取指定的单元，构件相应的虚拟组合初步筛选库；然后对获得的虚拟组合初步筛选库中的分子构象采用分子力场及单纯形法与共轭方向法相结合的空间搜索算法进行优化；<3>第三步对上述建立的虚拟组合初步筛选库进行评价及其优化，包括：首先建立包括建立分子活性评价模块、建立分子类药性评价模块、建立分子多样性评价模块以及建立不良的药物动力学性质或不适宜的毒性反应评价模块的评价体系；然后采用遗传算法对虚拟组合初步筛选库的化合物进行优化。