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Die Erfindung betrifft ein Mikroskopiesystem 1 zur Beobachtung von Fluoreszenz eines Fluoreszenzfarbstoffs 27 in einem Objektbereich 2. Das Mikroskopiesystem 1 umfasst eine Mikroskopieoptik 5, 6, 7 mit einem Beleuchtungssystem 10 zur Bereitstellung von Beleuchtungslicht 12 für den Objektbereich 2, welches Wellenlängen im sichtbaren Spektralbereich enthält und Wellenlängen zur Anregung von Fluoreszenz des Fluoreszenzfarbstoffs 27 aufweist. Das Mikroskopiesystem 1 enthält eine Mikroskop-Bilderfassungseinheit 100, welcher ein Strahlungsfluss von Fluoreszenzlicht aus dem Objektbereich zugeführt wird. Das Mikroskopiesystem 1 hat ein Anzeigesystem 51, 52 zur Anzeige eines Bildes des Objektbereichs 2, das ein auf Fluoreszenzlicht basierendes Teilbild des Objektbereichs 2 enthält. Erfindungsgemäß ist eine Mikroskopiesystem-Steuereinheit 70 vorgesehen, die von einer Bedienperson in einen Fluoreszenzbetriebsmodus geschaltet werden kann und bei Einstellen des Fluoreszenzbetriebsmodus das Mikroskopiesystem 1 derart verstellt, dass in dem Mikroskopiesystem 1 der Strahlungsfluss von Fluoreszenzlicht aus dem Objektbereich 2 in die Mikroskop-Bilderfassungseinheit 100 maximal ist.
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