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Una cepa de Bacillus con capacidad de crecimiento y esporulación que tiene un cromosoma en el que: a) al menos un gen diana ha sido parcial o totalmente reemplazado por un gen homólogo procedente de otra bacteria, y b) un gen indicador introducido artificialmente está presente y se expresa de una manera tal que la expresión del gen indicador crece o decrece en asociación con un cambio en el nivel de actividad del producto de expresión del gen homólogo y donde en dicha cepa de Bacillus: A) a) un gen spoIIIE ha sido reemplazado por su homólogo procedente de otra bacteria, y b) están presentes dos genes indicadores cada uno unido a un promotor y con respuesta a la acción sF durante la esporulación, estando situado un primer gen indicador en un segmento de ADN que está atrapado en un compartimento de preespora cuando la función SpoIIIE está deteriorada, y estando situado un segundo gen indicador fuera de dicho segmento; o B) a) un gen de división celular ha sido parcial o totalmente reemplazadopor su homologo procedente de otra bacteria, y b) están presentes dos genes indicadores introducidos artificialmente, un primer gen indicador que tiene un promotor que es dependiente de factores sF o sE activos, y un segundo gen indicador el cual proporciona una medida de la síntesis del factor sF o sE (inactivo), o C) donde la cepa está modificada por una mutación de un gen spoIIIE que bloquea la transferencia del cromosoma de la preespora, y; a) un gen spoOJ ha sido reemplazado por su homólogo procedente de otra bacteria, y b) están presentes uno o dos genes indicadores, un primer gen indicador que tiene un promotor que es dependiente del factor sF y situado en una posición donde el deterioro de la función SpoOJ lleva a incrementar el atrapamiento y, por tanto, a incrementar la expresión en la preespora, y/o un segundo gen indicador que tiene un promotor que es dependiente del factor sF y situado en una posición donde el deterioro de la función SpoOJ lleva a reducir el atrapamiento y portanto a reducir la expresión en la preespora.
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