发明名称 |
利用双S形的曲率分析的PCR肘确定 |
摘要 |
本发明提供用于确定S形或生长型曲线中的例如肘值的特征过渡值、例如PCR扩增曲线中的周期阈值(Ct)的系统和方法。具有通过Levenberg-Marquardt(LM)回归方法所确定的参数的双S形函数被用于找到拟合PCR数据集的曲线的近似。一旦已经确定参数,就可以利用一个或多个所确定的参数来使曲线标准化。在标准化之后,处理标准化曲线以确定曲线在沿着该曲线的一些或所有点处的曲率,例如以产生表示曲率对周期数的数据集或图。出现最大曲率的周期数对应于Ct值。该Ct值然后被返回并且可以被显示或另外被用于进一步的处理。 |
申请公布号 |
CN101004765A |
申请公布日期 |
2007.07.25 |
申请号 |
CN200610169374.1 |
申请日期 |
2006.12.19 |
申请人 |
霍夫曼-拉罗奇有限公司 |
发明人 |
R·T·库尔尼克;J·王 |
分类号 |
G06F19/00(2006.01);C12Q1/68(2006.01);C12N15/09(2006.01) |
主分类号 |
G06F19/00(2006.01) |
代理机构 |
中国专利代理(香港)有限公司 |
代理人 |
卢江;王忠忠 |
主权项 |
1.一种计算机实现的、确定生长曲线的基线区域的末端处的点的方法,该方法包括以下步骤:-接收表示生长曲线的数据集,所述数据集包括多个数据点,每一个数据点都具有一对坐标值;-通过将Levenberg-Marquardt(LM)回归方法应用于双S形函数以确定该函数的参数来计算拟合所述数据集的曲线的近似;-利用所确定的参数使所述曲线标准化,以生成标准化曲线;以及-处理所述标准化曲线,以确定具有最大曲率的点,其中所述具有最大曲率的点表示生长曲线的基线区域的终点。 |
地址 |
瑞士巴塞尔 |