发明名称 一种蛋白质水解生产活性肽的分析程序
摘要 一种蛋白质水解生产活性肽的分析程序,属于生物活性肽技术领域和计算机领域。本发明利用MS Access软件分别建立蛋白质数据库、活性肽数据库和蛋白酶数据库,利用MS VB软件编写“生物活性肽搜寻与酶解模拟系统”程序,使程序具有调用后台的三个数据库,进行读取、分析蛋白质数据库、活性肽数据库、蛋白酶数据库,实现活性肽搜寻、活性肽功能预测、蛋白质模拟水解等功能。程序人机界面显示输入、输出信息,并把分析结果存储在相应的文件中。本发明将现代生物信息学技术与计算机技术相结合,使酶法水解蛋白质制备生物活性肽的工作上升至定性、定量的水平。
申请公布号 CN1996238A 申请公布日期 2007.07.11
申请号 CN200610166424.0 申请日期 2006.12.15
申请人 江南大学 发明人 乐国伟;施用晖;陈征松
分类号 G06F9/44(2006.01);G06F19/00(2006.01) 主分类号 G06F9/44(2006.01)
代理机构 无锡市大为专利商标事务所 代理人 时旭丹;刘品超
主权项 1、一种蛋白质水解生产活性肽的分析程序,其特征是利用MS Access软件分别建立蛋白质数据库、活性肽数据库和作为系统的后端数据库的蛋白酶数据库,蛋白质数据库中存储常见食物蛋白质的氨基酸一级序列信息,活性肽数据库存储活性肽的氨基酸序列信息,蛋白酶数据库存储蛋白酶的酶切位点信息;利用MS VB软件编写“生物活性肽搜寻与酶解模拟系统”程序,使程序具有调用后台的三个数据库,进行读取、分析蛋白质数据库、活性肽数据库、蛋白酶数据库,实现活性肽搜寻、活性肽功能预测与蛋白质模拟水解的分析功能,程序人机界面显示输入、输出信息,并把分析结果存储在相应的文件中;程序功能为:(1)活性肽搜寻:在程序打开之后输入要搜寻的目标肽序列,选择要搜寻的目标蛋白以后,点击“简单搜寻”或者“详细搜寻”,程序界面相应给出搜寻结果,用于初步预测目标蛋白中目标肽的含量;(2)活性肽功能预测:通过把序列已知,但功能未知的目标活性肽与活性肽库中肽进行比较,比对目标肽与肽库中已知序列、已知功能的肽重合度,预测目标活性肽的功能;(3)蛋白质模拟水解:选择目标蛋白后再选择用来水解目标蛋白的酶后,程序在计算机上模拟选定酶的位点水解目标蛋白,并对水解的片段与肽库中已知序列、已知功能的肽进行重合度比对,程序界面给出预测水解片段的功能。
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